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LYforever

新虫 (小有名气)

[求助] 关于大肠杆菌同源重组敲除基因的问题——请大家赐教!已有5人参与

最近在做大肠杆菌的基因缺失,用的是Red同源重组系统,一次重组已经完成,并测序正确,但最近一直卡在二次重组,每次电转后涂布到A+C的平板上(傍晚),第二天早上就会发现平板上长一层菌苔,涂布棒涂到的地方整个一片,已经重复做了很多次,但还是同样的问题,一直都不知道问题到底出在哪里,不知道如何是好,恳请前辈们赐教!
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tolobio

新虫 (小有名气)


【答案】应助回帖

商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
如果在大肠杆菌中做的话,我们成熟的做法是:先转入pKD46(或类似),然后开始诱导(注意菌株的状态,OD,以及阿拉伯糖要新鲜),最后做成感受态(电转化,现做现用)。
DNA方面,一般是通过PCR的方法,把抗性基因扩增下来,两端带有40nt(或以上)的同源臂(与待敲除基因的两端同源)。PCR产物一定要经过DpnI处理(去除之前的模板质粒),割胶纯化,然后elute到ddH2O中。再把DNA电转化到感受态中即可筛选。
好像不需要两次交换(先单交换后双交换?没有必要)。如需继续交流,欢迎联系我们:tolobio@126.com;或者support@tolobio.com
www.tolobio.com
10楼2015-10-19 06:49:45
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专吃虫

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
大肠长得太快了,你不应该过夜的,培养几个小时就行了,本来涂布就有很多菌了,再长那么快肯定成菌台了

发自小木虫Android客户端
2楼2015-10-16 07:29:44
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mlanqiang

木虫之王 (文学泰斗)

蓝博士

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
培养时间短一点看看。
蓝精灵
3楼2015-10-16 08:10:03
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胡亚梅

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
把菌的浓度降低一点,培养时间缩短。建议重新更换抗生素,感觉有抗生素失效的可能性
小虫虫~~
4楼2015-10-16 08:42:12
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老蔡文

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
第一次的pCP20没cure掉?
5楼2015-10-18 17:10:13
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LYforever

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 老蔡文 at 2015-10-18 17:10:13
第一次的pCP20没cure掉?

第一次用的pKD46

发自小木虫IOS客户端
6楼2015-10-18 21:50:50
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LYforever

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 胡亚梅 at 2015-10-16 08:42:12
把菌的浓度降低一点,培养时间缩短。建议重新更换抗生素,感觉有抗生素失效的可能性

好的,我试试,谢谢

发自小木虫IOS客户端
7楼2015-10-18 21:51:33
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LYforever

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by mlanqiang at 2015-10-16 08:10:03
培养时间短一点看看。

培养时间调了,现在倒是什么都不长了,不知是好是坏

发自小木虫IOS客户端
8楼2015-10-18 21:52:15
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LYforever

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 专吃虫 at 2015-10-16 07:29:44
大肠长得太快了,你不应该过夜的,培养几个小时就行了,本来涂布就有很多菌了,再长那么快肯定成菌台了

毕竟是筛选重组菌,效率不高的,不可能那一片菌苔都是阳性重组子啊

发自小木虫IOS客户端
9楼2015-10-18 21:53:24
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