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怎样查找一个属的特有序列呢？求教高手！ 已有2人参与
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在做假单胞菌属的分析，需要查找到假单胞菌属的特有基因序列，但是无从下手。 已在Goog学术，几web of science查过相关文章，大部分只是叙述了相关蛋白或功能基因，一来没有公开序列，二来也没有说明是否是该属特有的。 头疼中…… 等待高手。 |
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fengjunchen
铜虫 (小有名气)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 743.6
- 红花: 2
- 帖子: 136
- 在线: 77小时
- 虫号: 3548432
- 注册: 2014-11-20
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
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以16s为例，其序列还是相对保守的，保守区与可变区交错分布。像环境样品的二代测序确定种群分布，很多就是根据保守区来设计引物测可变区的序列（比如V3-V5），测序后就能知道样品里有啥物种了。具体我忘了精确度了，好像是能到 属 的？你自己查查看吧，16s二代测序和FISH的知识背景，应该能给你些启发的；当然可能也只是启发和借鉴，似乎和你想做的活儿还不太一样。真让我细解释我也说不清楚 (>_<  发自小木虫Android客户端 |
9楼2015-10-03 01:04:35
2楼2015-09-29 19:18:20
3楼2015-09-30 23:38:13
4楼2015-10-01 10:23:42
