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质粒构建问题,求大神帮忙看看
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小白鼠搞科研
新虫
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质粒构建问题,求大神帮忙看看
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本人构建质粒,载体是PGL3-basic,酶切位点Kpn1 ,Xho1,插入片段600bp,普通PCR条带很亮,酶切连接纯化浓度都不低,也适当提高片段浓度,涂板菌落长得很好,菌液PCR有条带很亮,但是一测序用普通PCR引物就没有信号,通用引物显示空载,双酶切检测也显示没有连上,求大神指导下到底哪里出错了。
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1楼
2015-09-19 12:59:10
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zzhjiangnan
银虫
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专业: 微生物遗传育种学
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
酶切效果不好,建议多切一段时间,菌P的引物是不是选的不好,无法区分空载和插入片段?
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6楼
2015-09-22 18:07:21
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evangelina
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流
2015-09-19 22:08:49
证明菌液PCR出来的都是假阳性,可能是PCR的试剂里面混了目标片段,又或者条件没设好出来非特异条带?
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2楼
2015-09-19 21:41:40
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lpuks
铜虫
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性别: GG
专业: 细胞信号转导
★
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涂板长得很好很多不能代表确实是连接产物,涂板时做control了吗?没有的话,长得很多有可能是自连呢。还有在连接时载体可以提前做一下去磷酸化处理。“菌落PCR有条带很亮”你做菌P时用的引物是什么引物,不会是在P目的片段时的所用的primer吧,如果真是用的P目的片段时的primer,就是真P出来了,也不能说明确实连接上了,所以建议菌P时用载体上的引物。回收的时候虽然浓度不低,但是最好跑胶看一下到底有没有真回收回来。
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3楼
2015-09-19 22:50:39
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renzhiq
木虫
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专业: 微生物学
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没有奖励,不太想参与讨论……
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4楼
2015-09-19 23:03:51
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