24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2242  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

tingting1204

兑换贵宾

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[求助] autodock软件使用求助 已有2人参与

1、使用的软件是ADT1.5.6,win64系统,运行autogrid成功,生成了需要的文件,但是运行autodock时,Docking>Macromolecule>Set Rigid Filename…>就无法载入蛋白了?!是不是软件没安装对啊?

2、我想着虽然无法载入蛋白,就先运行试试吧,也生成了dlg文件,但是打开结果文件后,出现了这样的红色提示,看不懂,请大家帮帮忙!

3、而且结果中,我的小分子也根本没有放到box里面去,求助啊!

autodock软件使用求助
360截图20150914101535090.jpg


autodock软件使用求助-1
360截图20150914102022033.jpg


autodock软件使用求助-2
360截图20150914102035600.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mondaystudy

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

我现在用autodock做对接遇到了同样的问题,你可以说一下您是怎么解决的吗?
6楼2018-01-19 16:45:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

pymol

禁虫


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的BOX设置不合理,重新设置一下,重新autogrid和autodock
2楼2015-09-14 14:02:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tingting1204

超级版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
2楼: Originally posted by pymol at 2015-09-14 14:02:21
你的BOX设置不合理,重新设置一下,重新autogrid和autodock

因为我不知道活性中心,所以把box设置为126*126*126,活性中心是默认的。问一下,这种情况下,我应该如何修改呢?
3楼2015-09-14 18:34:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pymol

禁虫


【答案】应助回帖

活性中心不能默认,看文献查找活性位点氨基酸残基,然后做参照
4楼2015-09-14 20:01:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 267求调剂 +9 uiybh 2026-03-31 9/450 2026-03-31 22:15 by 天倌赐福
[考研] 342求调剂 +7 Mary Keen 2026-03-28 7/350 2026-03-31 20:36 by 83503孙老师
[考研] 080200学硕,机械工程专业277分,求带走! +4 瓶子PZ 2026-03-31 4/200 2026-03-31 20:16 by vgtyfty
[考研] 286求调剂 +6 Faune 2026-03-30 6/300 2026-03-31 14:37 by jp9609
[考研] 354求调剂 +3 lxb598 2026-03-31 4/200 2026-03-31 13:42 by sophie2180
[考研] 求调剂,一志愿 南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕,总分289分 +9 @taotao 2026-03-29 9/450 2026-03-30 22:29 by 我是小康
[考研] 085600 286分 材料求调剂 +11 麻辣鱿鱼 2026-03-27 12/600 2026-03-30 19:33 by Wang200018
[考研] 289求调剂 +16 新时代材料 2026-03-27 16/800 2026-03-30 19:04 by Wang200018
[考研] 328求调剂 +8 嗯滴的基本都 2026-03-27 8/400 2026-03-30 17:20 by Wang200018
[考研] 296求调剂 +10 彼岸t 2026-03-29 10/500 2026-03-30 10:50 by 探123
[考研] 【求调剂】085601材料工程专硕 | 总分272 | +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-29 20:21 by dophin1985
[考研] 340求调剂 +6 Amber00 2026-03-26 6/300 2026-03-29 12:06 by 无际的草原
[考研] 0856求调剂 +13 zhn03 2026-03-25 14/700 2026-03-29 08:13 by fmesaito
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +7 小小甜面团 2026-03-25 7/350 2026-03-28 20:25 by 唐沐儿
[考研] 求调剂 +6 芦lty 2026-03-25 7/350 2026-03-28 13:13 by 唐沐儿
[考研] 295求调剂 +5 1428151015 2026-03-27 6/300 2026-03-28 04:04 by fmesaito
[考研] 330一志愿中国海洋大学 化学工程 085602 有读博意愿 求调剂 +3 wywy.. 2026-03-27 4/200 2026-03-28 03:32 by fmesaito
[考研] 314求调剂 +3 溪云珂 2026-03-26 3/150 2026-03-27 11:20 by sanrepian
[考研] 302求调剂 +4 锦衣卫藤椒 2026-03-25 4/200 2026-03-25 16:29 by 功夫疯狂
[考研] 求调剂 +3 李李不服输 2026-03-25 3/150 2026-03-25 13:03 by cmz0325
信息提示
请填处理意见