24小时热门版块排行榜    

查看: 1015  |  回复: 8

jiashuhua29

铜虫 (小有名气)

[求助] 载体构建 已有4人参与

一个CDS区大小为4000bp的基因,想构载体,可是设计好了引物从ATG开始到TGA 结束,怎么也跑不出来,这个基因有7种剪接体,一个都跑不出来,有什么好的解决方法吗
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
那要看看你是怎么做的才能帮你找原因啊

[ 发自小木虫客户端 ]

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2015-08-26 11:11:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiashuhua29

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by Neo2000 at 2015-08-26 11:11:01
那要看看你是怎么做的才能帮你找原因啊

你好,首先谢谢你的回复,我就是不想分段扩增,用了各种酶,pfu,LA,primeSTARTM HS等,程序都是严格按照说明书来做的,跑出来的条带一般都在1500bp左右,没有目的条带,我又按照网上说的先设一对引物在CDS外也就是UTR区,然后把跑出来的pcr产物稀释100倍,再用第二对引物也就是扩CDS区的引物来扩增,还是没有目的条带。
3楼2015-08-26 11:20:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

evangelina

无虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2015-08-26 23:06:07
jiashuhua29: 金币+20 2015-08-28 09:58:48
你可以试试把它拆分成两个片段,用overlapping PCR去做
例如说分成两个2k的片段,一般就比较好做PCR,先克隆到T载体,测序,如有变异先把它变回来
然后就用头尾的引物做PCR,再把全长片段克隆到目标载体

4k的基因如果直接克隆,如果是从cDNA会有的困难的
除非你用比较高级的逆转录酶和高保真酶

如果有钱的话,直接叫公司给你合成吧
又或者如果是很普遍的基因,直接从addgene之类的公司买,很便宜的
4楼2015-08-26 11:25:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiashuhua29

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by evangelina at 2015-08-26 11:25:49
你可以试试把它拆分成两个片段,用overlapping PCR去做
例如说分成两个2k的片段,一般就比较好做PCR,先克隆到T载体,测序,如有变异先把它变回来
然后就用头尾的引物做PCR,再把全长片段克隆到目标载体

4k的基 ...

谢谢,我的基因比较新,可能还是得靠自己做,我也试过分成两段,但是发现2000左右没有比较好的引物,设了一对结果也没跑出来,而且分成两段从ATG开始的那个引物和到TGA 的那个引物还是得用上,但是这两个引物本来就不是很好,我就怕分成两段也跑不出来。
5楼2015-08-26 11:33:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by evangelina at 2015-08-26 11:25:49
你可以试试把它拆分成两个片段,用overlapping PCR去做
例如说分成两个2k的片段,一般就比较好做PCR,先克隆到T载体,测序,如有变异先把它变回来
然后就用头尾的引物做PCR,再把全长片段克隆到目标载体

4k的基 ...

这和烧钱有什么区别,4k的片段,怎么着也得1w2吧,够做好多事了

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2015-08-26 13:34:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

RNA质量要好,引物OK了,一般都能扩出来的

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2015-08-26 13:35:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

AnaSequence

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-08-26 23:06:25
分段PCR,再重叠PCR。多分几段也没问题,引物扩增条件相近的话,不增加多少工作。合成基因也就是分500bp左右一段接好,再重叠PCR或同源重组。
8楼2015-08-26 13:53:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kangaroo0513

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-26 23:06:38
用KOD-FX试试,另外,可以分成两段,之间有20-40bp的overlap,然后直接一步同源重组到你要的载体里去。
9楼2015-08-26 16:01:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 jiashuhua29 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] fileCode有新解读? +8 Tide man 2026-08-08 16/800 2026-08-08 09:59 by Tide man
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 08:27 by 6vVgjDL4CnGu
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 3/150 2026-08-08 03:47 by 6vVgjDL4CnGu
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 关于filecode +4 布布和一二 2026-08-07 7/350 2026-08-07 22:55 by zhanghaozhu
[基金申请] 娱乐 +6 Tide man 2026-08-03 6/300 2026-08-07 22:40 by 铁帽子农民
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +9 且听虎啸 2026-08-07 12/600 2026-08-07 21:53 by 理想三旬2025
[基金申请] 固定端突然变了,今天 +6 archvillain 2026-08-06 10/500 2026-08-07 16:03 by 医学老男孩
[基金申请] 听说今天filecode变了 +24 布布和一二 2026-08-06 47/2350 2026-08-07 16:02 by zhiyanjiang
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[论文投稿] 十年后又回来了,论文投稿求助 +4 哈哈114477 2026-08-01 4/200 2026-08-07 14:39 by jgy194592
[基金申请] 大家散了吧,后缀研究没有意义,别浪费时间了,过好目前的每一天,不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 7/350 2026-08-07 13:11 by 医学老男孩
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +4 yang182083 2026-08-06 6/300 2026-08-07 12:43 by 虫友是什么虫
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 19/950 2026-08-07 12:20 by wlwhappy
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 有没有H口的?有收到消息的吗? +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[基金申请] 纯娱乐,不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见