应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 高通量测序数据拆分异常
51/1返回列表
查看: 2766  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)

[求助] 高通量测序数据拆分异常 已有2人参与

各位做过高通量测序的大侠：
      我刚刚学习使用高通量测序技术，是扩增子测序，菜鸟一个。之前送了一批样品，初步检测是合格的，但是过了没几天，测序公司说我的16个样品拆出的数据 都只有几百至几千条，按说初步样品检测浓度合格，下机拆分的数据量不会这么少，这样的数据根本没法进行后续分析，问我是不是提供的barcode信息有误，但是我核实了barcode都是正确的。
      但是公司也说不出其他原因，这么多样品都出问题，要是重做不仅浪费时间金钱，关键是样品放了那么久不知道能不能全部做出来了。头疼啊！指着这个毕业呢！！！
      请各位大侠指点迷津，这种数据拆分异常会是什么原因造成的？现在我该怎么办？
高手相助感激不尽！！！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

高通量测序

» 猜你喜欢
越努力越幸运
1楼 2015-08-15 10:28:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiajia1990

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
柠檬可乐星: 金币+5 2015-09-01 11:03:25
你的初步样品检测浓度合格，而且是16个样品拆出的数据都不合格，我觉得是测序公司的问题，我们以前也遇到类似的情况，建议让测序公司重测！！！
赞一下 回复此楼
6楼2015-08-22 09:23:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

我是鱼豆腐

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-22 23:07:03
柠檬可乐星: 金币+2 2015-09-01 11:03:00
barcode不该是公司给出的么，你可以先查看一下公司给你的数据分析结果，应该有个质量报告什么的；如果你DNA检测浓度和纯度合格的话，公司检测应该是没问题的。
赞一下 回复此楼
2楼2015-08-16 15:07:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

great07225388

新虫 (著名写手)
★
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-08-22 23:07:16
一般像扩增子测序，公司都有固定的流程，问题应该不大。建议看下究竟是测序的问题，还是建库的问题，还是样品制备的问题，等等。

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
3楼2015-08-16 17:16:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

柠檬可乐星

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 我是鱼豆腐 at 2015-08-16 15:07:31
barcode不该是公司给出的么，你可以先查看一下公司给你的数据分析结果，应该有个质量报告什么的；如果你DNA检测浓度和纯度合格的话，公司检测应该是没问题的。

公司一次给了很多barcode，自己扩增的时候使用了其中一部分，现在数据异常，公司怀疑是我提供给他们的我实验所用的barcode 信息有误。现在刚测完序，要下机拆分数据，结果就出现这种情况，公司觉得不正常，所以暂时没有往下进行，报告也没出
赞一下 回复此楼
越努力越幸运
4楼2015-08-17 08:22:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +8 困于星晨 2026-03-17 10/500 2026-03-23 13:05 by 醉在风里
[考研] 0854 考研调剂 招生了！AI 方向 +3 pk3725069 2026-03-19 13/650 2026-03-23 11:00 by 汪！？！
[考研] 291求调剂 +5 孅華 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:20 by haoshis
[考研] 323求调剂 +6 洼小桶 2026-03-18 6/300 2026-03-23 00:29 by king123！
[考研] 石河子大学（211、双一流）硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 286求调剂 +10 Faune 2026-03-21 10/500 2026-03-21 23:34 by 314126402
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考！ +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 化学调剂 +5 yzysaa 2026-03-21 5/250 2026-03-21 22:12 by peike
[考研] 【考研调剂】化学专业 281分，一志愿四川大学，诚心求调剂 +11 吃吃吃才有意义 2026-03-19 11/550 2026-03-21 18:23 by 学员8dgXkO
[考研] 307求调剂 +3 wyyyqx 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:20 by JourneyLucky
[考研] 材料工程（专）一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中国石油大学（华东） 本科齐鲁工业大学 +3 石能伟 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:22 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 296求调剂 +6 www_q 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:56 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南昌大学，327分，材料与化工085600 +9 Ncdx123456 2026-03-19 9/450 2026-03-20 23:41 by lovewei0727
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考研] 考研调剂求学校推荐 +3 伯乐29 2026-03-18 5/250 2026-03-20 22:59 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 材料，纺织，生物（0856、0710），化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林，给自己招师弟中～ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭