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nishang811

新虫 (小有名气)

[求助] 酶蛋白结构未知,同源建模后怎么做突变,求教,用moe2009 已有1人参与

如题,我先同源模建,然后我打开我的模板的PDB,把模板和建模的模型2个进行superpose,通过模板的酶结合位点找的大概的活性中心
用site finder   定义活性中心  、
然后受体定义为我的序列
位点为dummy的,配体是我的小分子,是用moe画的,进行对接
对接后的pose怎么看?E,V,那些得分怎么看是哪个
还有怎么选择我要突变的氨基酸,突变成什么应该
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pymol

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【答案】应助回帖

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感谢参与,应助指数 +1
nishang811: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-06-11 09:26:23
用pymol做下点突变就好
2楼2015-06-04 08:46:30
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