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lyxdjdj

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何显示对接后蛋白结合口袋的截面图 已有2人参与

本人从事分子模拟不久,已经通过Autodock Vina对一些分子进行对接。分析对接结果的时候不知道如何显示蛋白口袋的截面图,以更直观地看到小分子在什么程度上适应蛋白口袋。附图是Autodock Vina官网上显示的对接结果图,请问如何可以做这样的图?
我已经试过用Pymol的present-Ligand site和ADT里面的Protein surface,可是都不能得到附件中所示的样子。麻烦高手支招有什么软件可以做到吗?麻烦给详细的作图步骤~~~小女子感激不尽~~~~

另外,请问有什么软件可以用于虚拟筛选得到的小分子superimpose还有结构分析?分析官能团,氢键受体供体,极性,亲脂性和骨架?谢谢大家!

如何显示对接后蛋白结合口袋的截面图
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zhang360

新虫 (正式写手)

4楼2016-07-10 16:50:32
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