24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
汕头大学海洋科学接受调剂
查看: 4990  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

天际之虹

金虫 (小有名气)

[求助] msi2lmp将MS文件转换为lammps的data文件时,出现Unable to find bond data for c1 ct 已有1人参与

我按照论坛里面其他帖子的方法,将MS中的文件保存为car格式后,利用msi2lmp转换时,在data.xxxx中出现这样的信息。我是在Windows下运行的。
Running msi2lmp v3.9.6 / 11 Sep 2014

Forcefield: Class II
Forcefield file name: ..\frc_files\cff91.frc
Output is recentered around geometrical center
Output contains style flag hints
System translated by: 0 0 0
Reading car file: test.car
Reading mdf file: test.mdf

Building internal coordinate lists

Reading forcefield file

Get force field parameters for this system
Unable to find bond data for c1 ct
最后一句是找不到c1 和 ct的化学键数据吗?我在下面把我的mdf文件中的信息列出来了,请各位大侠帮忙看看应该怎么解决这个问题,跪谢orz
!BIOSYM molecular_data 4

!Date: Mon May 11 21:45:42 2015   Materials Studio Generated MDF file

#topology

@column 1 element
@column 2 atom_type
@column 3 charge_group
@column 4 isotope
@column 5 formal_charge
@column 6 charge
@column 7 switching_atom
@column 8 oop_flag
@column 9 chirality_flag
@column 10 occupancy
@column 11 xray_temp_factor
@column 12 connections

@molecule Sketch1

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch3

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch1_AC1

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC2

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC3

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC4

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC5

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC6

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC7

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC8

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC9

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch3_AC1

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC2

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC3

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC4

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC5

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC6

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC7

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC8

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC9

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

!
#symmetry
@periodicity 3 xyz
@group (P1)


#atomset

@list backbone Sketch1

Sketch1:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch3

Sketch3:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch1_AC1

Sketch1_AC1:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC2

Sketch1_AC2:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC3

Sketch1_AC3:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC4

Sketch1_AC4:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC5

Sketch1_AC5:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC6

Sketch1_AC6:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC7

Sketch1_AC7:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC8

Sketch1_AC8:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC9

Sketch1_AC9:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch3_AC1

Sketch3_AC1:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC2

Sketch3_AC2:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC3

Sketch3_AC3:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC4

Sketch3_AC4:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC5

Sketch3_AC5:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC6

Sketch3_AC6:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC7

Sketch3_AC7:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC8

Sketch3_AC8:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC9

Sketch3_AC9:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

#end
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

该觉醒了!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cshcgy

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

关于msi2lmp出错unable to find…..data的解析——Pcff力场分配参数流程
https://www.shehunotes.cn/?p=226
5楼2020-10-31 11:32:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

zuodong009

新虫 (初入文坛)

我也是这种问题,请问楼主解决了吗
2楼2016-04-10 17:45:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gt54g1h4

新虫 (初入文坛)

我也是这个问题,楼主有解决办法吗
3楼2016-09-05 10:35:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guozhijing

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gt54g1h4 at 2016-09-05 10:35:03
我也是这个问题,楼主有解决办法吗

楼主,问题解决了吗

发自小木虫Android客户端
人生最精彩的不是实现梦想的瞬间,而是坚持梦想的过程
4楼2016-10-19 11:39:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 279学硕食品专业求调剂院校 20+6 孤独的狼爱吃羊 2026-04-12 26/1300 2026-04-14 09:04 by zs92450
[考研] 求调剂 +11 何气正 2026-04-13 12/600 2026-04-13 20:14 by 学员JpLReM
[考研] 一志愿211 0703化学 346分求调剂 +26 土豆er? 2026-04-09 29/1450 2026-04-13 15:15 by 独醉梦孤城
[考研] 290求调剂 +18 柯淮然 2026-04-12 20/1000 2026-04-13 12:56 by cyh—315
[考研] 290调剂生物0860 +28 哇哈哈,。 2026-04-11 31/1550 2026-04-13 01:16 by 幸免 ..
[教师之家] 山东双非院校考核超级无底线,领导幸灾乐祸,教师遭殃恐 +3 qut2026 2026-04-11 7/350 2026-04-12 20:24 by qut2026
[考研] 2本,初试303,0860求调剂 +6 floriea 2026-04-12 8/400 2026-04-12 18:13 by zhouxiaoyu
[考研] 295分求调剂 +13 ?要上岸? 2026-04-10 13/650 2026-04-12 15:37 by laoshidan
[考研] 求调剂 +16 张番茄不炒蛋 2026-04-10 17/850 2026-04-12 13:58 by 熬夜成!
[考研] 22408调剂315分 +3 zhuangyan123 2026-04-09 3/150 2026-04-12 00:25 by 蓝云思雨
[考研] 296求调剂 +8 汪!?! 2026-04-09 8/400 2026-04-11 21:02 by 逆水乘风
[考研] 284求调剂 +11 archer.. 2026-04-09 12/600 2026-04-11 20:23 by 蓝云思雨
[考研] 调剂求助 +6 果然有我 2026-04-11 7/350 2026-04-11 16:22 by 明月此时有
[考研] 求调剂,一志愿大连理工大学354分 +5 雨声余生 2026-04-11 6/300 2026-04-11 16:12 by 雨声余生
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +16 叶zilin 2026-04-10 16/800 2026-04-11 11:04 by may_新宇
[考研] 机械专硕270求调剂,接受跨专业 +12 老师看看我吧aba 2026-04-09 14/700 2026-04-11 10:21 by laoshidan
[考研] 337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 08:57 by zhq0425
[考研] 求调剂 材料与工程 324分 专硕 +19 翩翩一书生 2026-04-10 21/1050 2026-04-10 11:41 by wp06
[考研] 292求调剂 +9 笑笑袁 2026-04-09 9/450 2026-04-10 10:05 by LHGeng
[考研] 277、学硕,求调剂 数一104, +11 瓶子PZ 2026-04-07 12/600 2026-04-07 23:30 by 一只好果子?
信息提示
请填处理意见