24小时热门版块排行榜    

查看: 5150  |  回复: 4

天际之虹

木虫 (小有名气)

[求助] msi2lmp将MS文件转换为lammps的data文件时,出现Unable to find bond data for c1 ct 已有1人参与

我按照论坛里面其他帖子的方法,将MS中的文件保存为car格式后,利用msi2lmp转换时,在data.xxxx中出现这样的信息。我是在Windows下运行的。
Running msi2lmp v3.9.6 / 11 Sep 2014

Forcefield: Class II
Forcefield file name: ..\frc_files\cff91.frc
Output is recentered around geometrical center
Output contains style flag hints
System translated by: 0 0 0
Reading car file: test.car
Reading mdf file: test.mdf

Building internal coordinate lists

Reading forcefield file

Get force field parameters for this system
Unable to find bond data for c1 ct
最后一句是找不到c1 和 ct的化学键数据吗?我在下面把我的mdf文件中的信息列出来了,请各位大侠帮忙看看应该怎么解决这个问题,跪谢orz
!BIOSYM molecular_data 4

!Date: Mon May 11 21:45:42 2015   Materials Studio Generated MDF file

#topology

@column 1 element
@column 2 atom_type
@column 3 charge_group
@column 4 isotope
@column 5 formal_charge
@column 6 charge
@column 7 switching_atom
@column 8 oop_flag
@column 9 chirality_flag
@column 10 occupancy
@column 11 xray_temp_factor
@column 12 connections

@molecule Sketch1

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch3

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch1_AC1

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC2

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC3

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC4

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC5

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC6

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC7

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC8

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch1_AC9

C7H1_1:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C7H1_1:C2           C  c1      ?     0  0    -0.0130 0 0 8 1.0000  0.0000 C1 H4 C4 C3
C7H1_1:C3           C  ct2     ?     0  0     0.2054 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 N1/3.0
C7H1_1:N1           N  nt      ?     0  0    -0.2454 0 0 8 1.0000  0.0000 C3/3.0
C7H1_1:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C7H1_1:H4           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C7H1_1:C4           C  c2      ?     0  0    -0.1060 0 0 8 1.0000  0.0000 C2 H5 H6 C5
C7H1_1:C5           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C4 C6/2.0 H7
C7H1_1:C6           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C5/2.0 C7 H8
C7H1_1:C7           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C6 H9 H10 H11
C7H1_1:H5           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C7H1_1:H7           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C5
C7H1_1:H8           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C6
C7H1_1:H9           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H10          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7
C7H1_1:H11          H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C7

@molecule Sketch3_AC1

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC2

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC3

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC4

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC5

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC6

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC7

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC8

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

@molecule Sketch3_AC9

C4H8_2:H1           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:C1           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 H1 C2 H2 H3
C4H8_2:C2           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C1 C3/2.0 H4
C4H8_2:C3           C  c=      ?     0  0    -0.1268 0 1 8 1.0000  0.0000 C2/2.0 C4 H5
C4H8_2:C4           C  c3      ?     0  0    -0.1590 0 0 8 1.0000  0.0000 C3 H6 H7 H8
C4H8_2:H2           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H3           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C1
C4H8_2:H4           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C2
C4H8_2:H5           H  hc      ?     0  0     0.1268 0 0 8 1.0000  0.0000 C3
C4H8_2:H6           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H7           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4
C4H8_2:H8           H  hc      ?     0  0     0.0530 0 0 8 1.0000  0.0000 C4

!
#symmetry
@periodicity 3 xyz
@group (P1)


#atomset

@list backbone Sketch1

Sketch1:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch3

Sketch3:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch1_AC1

Sketch1_AC1:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC2

Sketch1_AC2:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC3

Sketch1_AC3:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC4

Sketch1_AC4:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC5

Sketch1_AC5:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC6

Sketch1_AC6:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC7

Sketch1_AC7:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC8

Sketch1_AC8:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch1_AC9

Sketch1_AC9:C7H1_1:H3 C1 C2 C4 C5 C6
C7 H11

@list backbone Sketch3_AC1

Sketch3_AC1:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC2

Sketch3_AC2:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC3

Sketch3_AC3:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC4

Sketch3_AC4:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC5

Sketch3_AC5:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC6

Sketch3_AC6:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC7

Sketch3_AC7:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC8

Sketch3_AC8:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

@list backbone Sketch3_AC9

Sketch3_AC9:C4H8_2:H1 C1 C2 C3 C4 H8

#end
回复此楼
该觉醒了!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zuodong009

新虫 (初入文坛)

我也是这种问题,请问楼主解决了吗
2楼2016-04-10 17:45:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gt54g1h4

新虫 (初入文坛)

我也是这个问题,楼主有解决办法吗
3楼2016-09-05 10:35:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guozhijing

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gt54g1h4 at 2016-09-05 10:35:03
我也是这个问题,楼主有解决办法吗

楼主,问题解决了吗

发自小木虫Android客户端
人生最精彩的不是实现梦想的瞬间,而是坚持梦想的过程
4楼2016-10-19 11:39:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cshcgy

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

关于msi2lmp出错unable to find…..data的解析——Pcff力场分配参数流程
https://www.shehunotes.cn/?p=226
5楼2020-10-31 11:32:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 天际之虹 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +9 瞬息宇宙 2026-08-31 17/850 2026-09-02 14:04 by anjeeshine
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 10/500 2026-09-02 11:35 by 大不刘6
[文学芳草园] 梦想 +5 myrtle 2026-08-26 8/400 2026-09-02 02:42 by Leogzhya
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见(F口面上) +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 国社科又开始会评了,不知道这次命运如何 +7 雨打竹帘 2026-08-30 11/550 2026-08-31 23:16 by hittle2008
[基金申请] 基金未中,这种答复是模板吗? +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 中青基了要发朋友圈吗? +7 349506619 2026-08-28 7/350 2026-08-31 13:39 by 冼亮淀粉酶
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 我就是申请一个面上项目而已,这评审意见是按照杰青的条件评的吧? +6 gouxfjh 2026-08-28 11/550 2026-08-30 07:57 by gouxfjh
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 看板上这么多中的,有点像50人群里49个人都是骗子的那种感觉…… +5 a089 2026-08-26 6/300 2026-08-27 14:05 by jonewore
信息提示
请填处理意见