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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » SSR引物貌似扩出两个位点，怎么办？
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明天TLL

新虫 (初入文坛)

[求助] SSR引物貌似扩出两个位点，怎么办？ 已有1人参与

我参考的文献里的引物，是直接在我做的物种上开发出来的。1.5%琼脂糖电泳检测PCR产物的时候是单一明亮的条带，大小跟参考长度差不多。可是上8%聚丙烯以后在目标产物位置附近一般都有2-4条带，貌似我的引物扩出来的是两个位点，虽然下面一行条带大小更接近我的目标条带，可是可以这样直接取舍吗？我筛了10对引物，几乎每对都是这样，有的引物扩出的两个疑似位点大小更接近。怎么办啊？

SSR引物貌似扩出两个位点，怎么办？
5.jpg
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1楼 2015-05-11 10:26:33
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明天TLL

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yingheqian at 2015-05-11 20:21:15
SSR 标记扩增用PAGE检测时出现ghost是正常现象，建议换检测方法吧，HRM(高分辨率溶解曲线）不错，还有就是标记荧光，用测序仪

你是指那些差10bp左右的两条带是杂合，而四条带的是影子峰吗？

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2015-05-12 22:35:45
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yingheqian

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2015-05-12 13:31:15
明天TLL: 金币+5, ★有帮助 2015-05-13 14:29:36
SSR 标记扩增用PAGE检测时出现ghost是正常现象，建议换检测方法吧，HRM(高分辨率溶解曲线）不错，还有就是标记荧光，用测序仪
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2楼2015-05-11 20:21:15
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一品红草莓

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yingheqian at 2015-05-11 20:21:15
SSR 标记扩增用PAGE检测时出现ghost是正常现象，建议换检测方法吧，HRM(高分辨率溶解曲线）不错，还有就是标记荧光，用测序仪

想知道HRM 怎么做SSR
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4楼2018-11-24 17:43:51
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