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luffyheipi

银虫 (初入文坛)

[求助] 关于构建基因文库中Sau3AI , BamHI 均切不动基因组DNA的问题。 已有2人参与

大家好!
   本人初次在小木虫上发帖,各方面如有不当之处,还望大家包涵。先行谢过了!
   我最近在构建一株细菌的基因组文库,大量抽提了基因组DNA 5次,每次DNA的浓度均在1000-2000ng/ul之间,A260/280都在1.8-2.0之间,A260/230也都大于2.0.跑胶检测,条带很亮,均一,无拖带。
   然后,问题来了。用Sau3AI预酶切时,酶切体系是20ul。但是,酶的稀释比例从5-50倍,酶量2ul,时间从15-120min都试过,几乎都切不动,酶是新买的。少有的切动的情况,想再次重复也重复不出来。之后,改用BamHI,50ul体系,3ul的酶,其他是buffer和DNA。酶切时间从8-24h也都切不动。于是,想检测一下基因组DNA有没有什么问题。用基因组DNA作模板,通用引物扩增16S rDNA,都能扩增出来。用DpnI酶切基因组DNA 1h,也切不动。
   以上是我遇到的问题,以及尝试解决问题所做的努力。如有叙述不清楚之处,也请见谅!
   恳请有这方面的经验的高手能给我一些指点和建议。将不胜感激!
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tmoonday

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
luffyheipi: 金币+10, 有帮助, 好吧,我试试。 2015-05-08 10:48:04
同学我很同情你,建议你试试HindIII限制性内切酶。
等一份缘分
2楼2015-05-08 10:41:36
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Nabarro

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

Sau对细菌上的甲基化酶敏感,换个酶吧,你可以百度一下Sau内切酶了解一下,再百度甲基化酶了解一下。
3楼2015-11-13 21:36:35
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