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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 从16srna序列中找出高变区并设计引物
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A8610587

新虫 (小有名气)

[求助] 从16srna序列中找出高变区并设计引物 已有1人参与

已经将多株菌（菌A/菌B....都是乳酸菌）的16sRNA全长测序，需要找到它们的高变区并设计引物。
但是不知道怎么找到高变区，分子小白一枚求指教。

目的：因为我的样品中有很多种菌，我需要鉴定出当中是否有菌A/菌B..所以想设计出每株高变区的引物，然后PCR观察，不知道我的思路可不可行
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1楼 2015-04-30 09:35:42
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guxinhan123

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
多序列比对就可以寻找可变区，很多软件都可以做 dnaman CLUSTALW
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2楼2015-04-30 13:14:41
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