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gl6119278

新虫 (初入文坛)

[求助] 求解NMR~~~求指导解谱方法 已有1人参与

各位大神们好,最近做了几个核磁,这是葡甘露二糖的核磁资料,原始数据都在,求指导如何解谱,该糖是一个葡萄糖和一个甘露糖结合而成的一个二糖。请教如何确定C峰的归属,如何确定糖苷键类型。不胜感激!谢谢
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  • 2015-04-26 15:37:10, 37.46 M

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hydros

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
archbishop: 金币+10, ACI+1 2015-04-27 16:30:54
引用回帖:
8楼: Originally posted by gl6119278 at 2015-04-27 07:49:53
老师您好,请问能否从H-1' 的两个峰的化学位移是 5.08和4.81来认定既有alpha又有beta型的甘露糖呢?我刚学习解谱,懂的太少,书上有这么一段“对于吡喃糖来说,在1H NMR中,吡喃糖构型的α构型通常在4.9~ ...

吡喃糖构型的α构型通常在4.9~5.3之间,JH1,H2在0~3Hz之间;β构型通常在4.4~4.8之间,J H1,H2在6~8Hz之间,双峰[17]。但是甘露糖构型不能用此方法来判断。
对葡萄糖来说这个方法是可取的。你后面说的判断甘露糖构型的方法不一定行得通,一是氢谱化学位移差别太小,不好判断;二是糖上的质子信号大部分都重叠在一起,很难区分。

我建议你可以尝试下述方法
1. 氢谱上,葡萄糖端基氢的耦合常数大,找出葡萄糖信号,再根据QC找出葡萄糖的1位碳。
2. 综合COSY, QC归属葡萄糖的信号。
3. 根据BC 判断葡萄糖1位羟基是游离还是成苷,如果成苷,进一步结合COSY判断与甘露糖的链接位置。
4. 甘露糖的构型根据其1位碳的化学位移判断,对游离的甘露糖,alpha构型1位碳化学位移93左右,beta构型的则接近100,1位成苷 的甘露糖我没仔细研究过,你看看能否查阅文献找规律
5. 侧面认证:天然的葡甘聚糖,糖的构型应该是已知的,你查查文献。酶解过程不会影响糖 的构型。

至于C6,C6‘化学位移和单糖差别较大,很正常的现象,原因很复杂,不同的仪器,不同的溶剂作谱化学位移都不一样。聚糖其他基团也会影响C6的化学位移(机理和影响程度不详)。不要纠结这个问题,C6,C6’化学位移在59-63之间都是正常的。

数据归属期间,有可能会遇到各种无法预知的问题,你最好在你身边找一位懂解谱的一起分析。
9楼2015-04-27 14:29:02
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普通回帖

hydros

金虫 (著名写手)

C峰的归属不是几句话能说明白的,可能会写成一篇文章的篇幅。你不如参考文献自己做吧,或者悬赏金币请别人做。我简单看了一下谱。如果真如你所说是个二糖,应该是混合物,即不同连接顺序的二糖。
2楼2015-04-26 20:08:52
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gl6119278

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hydros at 2015-04-26 20:08:52
C峰的归属不是几句话能说明白的,可能会写成一篇文章的篇幅。你不如参考文献自己做吧,或者悬赏金币请别人做。我简单看了一下谱。如果真如你所说是个二糖,应该是混合物,即不同连接顺序的二糖。

感谢帮助,的确是一个混合物,我忘记说了,您说的很对,非常感谢,能请您帮忙解析吗?
3楼2015-04-26 21:39:44
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gl6119278

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hydros at 2015-04-26 20:08:52
C峰的归属不是几句话能说明白的,可能会写成一篇文章的篇幅。你不如参考文献自己做吧,或者悬赏金币请别人做。我简单看了一下谱。如果真如你所说是个二糖,应该是混合物,即不同连接顺序的二糖。

您方便帮我看下C6和C6'的化学位移吗?为什么跟单糖的对不上呢?应该怎么解释呢

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2015-04-26 23:05:00
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hydros

金虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by gl6119278 at 2015-04-26 23:05:00
您方便帮我看下C6和C6'的化学位移吗?为什么跟单糖的对不上呢?应该怎么解释呢
...

我今晚抽空看看,上班时不太方便

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2015-04-27 06:01:14
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hydros

金虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by gl6119278 at 2015-04-26 23:05:00
您方便帮我看下C6和C6'的化学位移吗?为什么跟单糖的对不上呢?应该怎么解释呢
...

混合物做信号全归属,做定量碳谱比较容易,准确。普通碳谱也可以归属。做为原料的两个糖,是不是beta葡萄糖,alpha甘露糖?

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2015-04-27 06:10:44
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gl6119278

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hydros at 2015-04-27 06:10:44
混合物做信号全归属,做定量碳谱比较容易,准确。普通碳谱也可以归属。做为原料的两个糖,是不是beta葡萄糖,alpha甘露糖?
...

太感谢您了,这个糖是通过酶解葡甘露聚糖获得的,做核磁的老师说是一对化合物,(不过他让我自己去解谱),我的水平只能确定第一个糖是beita型葡萄糖,第二个是什么型的甘露糖我也不知道~再次感谢您的热情帮助!

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2015-04-27 06:51:29
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gl6119278

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hydros at 2015-04-27 06:10:44
混合物做信号全归属,做定量碳谱比较容易,准确。普通碳谱也可以归属。做为原料的两个糖,是不是beta葡萄糖,alpha甘露糖?
...

老师您好,请问能否从H-1' 的两个峰的化学位移是 5.08和4.81来认定既有alpha又有beta型的甘露糖呢?我刚学习解谱,懂的太少,书上有这么一段“对于吡喃糖来说,在1H NMR中,吡喃糖构型的α构型通常在4.9~5.3之间,JH1,H2在0~3Hz之间;β构型通常在4.4~4.8之间,J H1,H2在6~8Hz之间,双峰[17]。但是甘露糖构型不能用此方法来判断。由于J1,2非常小,不能用J1,2间的偶合常数来确定甘露糖的α或β构型,需通过该单糖残基上的H5[24]和C5[33]的化学位移与已知单糖的H5和C5的化学位移来判断:一般来说,α-甘露糖构型比β-甘露糖构型的H5的化学位移与已知对照向低场移动0.4ppm左右,而C5的化学位移却向高场移动了4ppm左右。吡喃糖构型还可以通过HMQC谱,吡喃糖构型的α构型的JC1,H1在170Hz左右;β构型的JC1,H1在160Hz左右[17] 。”可是我根本找不到H-5'和C-5'
8楼2015-04-27 07:49:53
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gl6119278

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by hydros at 2015-04-27 14:29:02
吡喃糖构型的α构型通常在4.9~5.3之间,JH1,H2在0~3Hz之间;β构型通常在4.4~4.8之间,J H1,H2在6~8Hz之间,双峰。但是甘露糖构型不能用此方法来判断。
对葡萄糖来说这个方法是可取的。你后面 ...

非常感谢老师您的无私帮助。让我受益匪浅。只是这个:“4. 甘露糖的构型根据其1位碳的化学位移判断,对游离的甘露糖,alpha构型1位碳化学位移93左右,beta构型的则接近100”,我看的书上写的分别是95和94.6啊,按照您说的那样应该是alpha甘露糖了,我的核磁知识还是太少,您的建议非常好,我再想想办法,辛苦您了,再次感谢您的热情帮助,谢谢。
10楼2015-04-27 22:10:42
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