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zhouxianglzy

新虫 (小有名气)

[求助] 糖的三维结构在哪里下载 已有2人参与

蛋白质的结构可以在PDB 上下载,那么糖 比如肝素的结构从哪里下载?
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
NCBI的pubchem compound里头有,检索方法和PDB类似。
肝素:
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/32756#section=Top

葡萄糖:
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/53782692#section=Top

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2楼2015-04-20 09:05:53
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zhouxianglzy

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2015-04-20 09:05:53
NCBI的pubchem compound里头有,检索方法和PDB类似。
肝素:
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/32756#section=Top

葡萄糖:
http://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/53782692#section=Top...

下载的格式可以在VMD中打开吗
3楼2015-04-20 10:23:59
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhouxianglzy at 2015-04-20 10:23:59
下载的格式可以在VMD中打开吗...

这个我倒没有试过!你可以试试一下。NCBI的网站好像有PDB格式的,你下载的时候留意一下。
4楼2015-04-20 11:56:21
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anquren

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
PDB 中不只是蛋白质结构,除了蛋白质外,也有核酸及多糖的结构。
5楼2015-04-21 10:51:16
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