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葵cc_

木虫 (小有名气)

[交流] 如何用vmd看neb的结果 已有5人参与

想用vasp计算原子在表面的扩散势垒,通过NEB,计算出结果之后,使用nebmovie.pl 产生了movie和movie.vasp 两个文件。本人使用的vasp版本是5.3的,NEB是http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/download.html 网站上的Version: 3.1, Mar. 28, 2014 (compatible with vasp.5.3.x)版本。
      查找了小木虫上一些入门资料,都是用nebmovie.pl 产生了movie和movie.xyz两个文件,我的问题:
(1)不知道movie.vasp和movie.xyz这两个文件是不是就是一样的
(2)movie.vasp和movie.vasp这两个文件要怎么看,读不懂
(3)尝试用vmd观察这两个文件,但好像不成功,请问有人能介绍一下怎么用vmd看neb的结果吗?
谢谢~~~
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luzihen

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by valenhou001 at 2016-06-19 20:03:02
1. movie.vasp格式的可能与POSCAR格式类似的文件,只不过把多个POSCAR合并写到了一个文件。里面除了原子坐标信息,还有晶格矢量的信息。而movie.xyz是xyz格式的文件,里面只还有原子坐标和原子个数之类的信息,它里 ...

poscar只读取一帧
6楼2016-06-21 20:54:25
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查看全部 7 个回答

抖抖豆豆

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主问题解决了吧,,,可否分享下解决办法,,回答下你之前的三个问题,,,求助~~~~~谢谢谢谢,谢谢谢谢
work doesn't work without play
2楼2016-04-18 12:14:01
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wuning128

捐助贵宾 (小有名气)

3楼2016-04-18 20:20:07
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蛋蛋小童鞋

版主 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我很奇怪的是我的无法产生movie。vasp文件,但是到可以生成movie。xyz文件,求交流
愿不负最苦的时光
4楼2016-06-17 16:38:18
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