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tea_gl9871铜虫 (正式写手)
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[求助]
二代测序数据挖掘内参基因，请虫友指教！
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做了一个植物的de novo测序，想从中挖掘一些内参基因，我现在的策略是找拟南芥等模式物种中和近缘物种里已确定的reference gene，在我的测序数据中做同源比对，然后开发我这个物种的内参基因。 但这牵扯到一个问题，比如，拟南芥actin基因在我的测序数据中有很多高同源的转录本，我怎么确定用哪个转录本做内参模板序列？ 另外，不知道是否还有其他高效方法，能否从生信的角度直接发掘内参基因位点？ 求围观，求指教！ |
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