应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 二代测序数据挖掘内参基因，请虫友指教！
11/1返回列表
查看: 1305  |  回复: 0
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

tea_gl9871

铜虫 (正式写手)

[求助] 二代测序数据挖掘内参基因，请虫友指教！

做了一个植物的de novo测序，想从中挖掘一些内参基因，我现在的策略是找拟南芥等模式物种中和近缘物种里已确定的reference gene，在我的测序数据中做同源比对，然后开发我这个物种的内参基因。
但这牵扯到一个问题，比如，拟南芥actin基因在我的测序数据中有很多高同源的转录本，我怎么确定用哪个转录本做内参模板序列？
另外，不知道是否还有其他高效方法，能否从生信的角度直接发掘内参基因位点？
求围观，求指教！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2015-04-07 10:45:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~

科研从小木虫开始，人人为我，我为人人
相关版块跳转 我要订阅楼主 tea_gl9871 的主题更新
11/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭