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dkgmx

木虫 (正式写手)

[求助] 关于gaussianTD计算吸收光谱和优化问题 已有1人参与

小弟先用分子动力学跑了小分子配体和DNA的体系,然后想用TD计算模拟小分子在DNA存在下的光谱,gaussian输入文件关键词为# oniom(B3LYP/6-31G(d,p) TD(nstates=100):amber)  scrf=pcm,运行之后正常结束,没有进行OPT这过程,请问这样的数据可行吗?
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坚持
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dkgmx

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-04-07 08:54:42
我对分子动力学不太懂。我说说我高斯的理解。同时,你多多问一楼枪神,他懂得多。
1:高斯优化基态(DFT),然后基于基态做td,这叫吸收。做出来的谱叫吸收谱
2:高斯优化激发态(TD-DFT),优化后的结果,里面有 ...

首先非常感谢师兄的指点!可小弟想表达的是我把师兄回复的第一点当中的高斯优化基态(DFT)这一步去掉了,直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算,结果是正常结束,激发态跃迁数据也有了,问题就是没有进行优化这一步,这样的数据是否可行呢~
坚持
4楼2015-04-07 10:42:27
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不加opt是吸收谱,加了opt是发射谱
2楼2015-04-07 08:19:51
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小范范1989

木虫 (著名写手)

我对分子动力学不太懂。我说说我高斯的理解。同时,你多多问一楼枪神,他懂得多。
1:高斯优化基态(DFT),然后基于基态做td,这叫吸收。做出来的谱叫吸收谱
2:高斯优化激发态(TD-DFT),优化后的结果,里面有个s1的波长,这叫做发射,做出来的谱线,叫做发射谱
以上是我的理解,不对之处还请指点,谢谢
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
3楼2015-04-07 08:54:42
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小范范1989

木虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dkgmx at 2015-04-07 10:42:27
首先非常感谢师兄的指点!可小弟想表达的是我把师兄回复的第一点当中的高斯优化基态(DFT)这一步去掉了,直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算,结果是正常结束,激发态跃迁数据也有了,问题就是没有进行 ...

按说吸收,应该是分子从基态吸收,你说:‘直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算’。你的意思是,你是从s0做的td?如果是从s0做的td,应该没问题。但是如果你不能保证你做td的时候的结构是s0,那么这个td应该就没有意义吧。这事我的理解。不一定对。我比较水、

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
5楼2015-04-07 14:53:53
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