应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 关于gaussianTD计算吸收光谱和优化问题
71/1返回列表
查看: 1835  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

dkgmx

木虫 (正式写手)

[求助] 关于gaussianTD计算吸收光谱和优化问题 已有1人参与

小弟先用分子动力学跑了小分子配体和DNA的体系，然后想用TD计算模拟小分子在DNA存在下的光谱，gaussian输入文件关键词为# oniom(B3LYP/6-31G(d,p) TD(nstates=100):amber)  scrf=pcm，运行之后正常结束，没有进行OPT这过程，请问这样的数据可行吗？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
坚持
1楼 2015-04-06 12:43:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不加opt是吸收谱，加了opt是发射谱
赞一下 回复此楼
2楼2015-04-07 08:19:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)
我对分子动力学不太懂。我说说我高斯的理解。同时，你多多问一楼枪神，他懂得多。
1：高斯优化基态（DFT），然后基于基态做td，这叫吸收。做出来的谱叫吸收谱
2：高斯优化激发态（TD-DFT），优化后的结果，里面有个s1的波长，这叫做发射，做出来的谱线，叫做发射谱
以上是我的理解，不对之处还请指点，谢谢
赞一下 回复此楼
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
3楼2015-04-07 08:54:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dkgmx

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-04-07 08:54:42
我对分子动力学不太懂。我说说我高斯的理解。同时，你多多问一楼枪神，他懂得多。
1：高斯优化基态（DFT），然后基于基态做td，这叫吸收。做出来的谱叫吸收谱
2：高斯优化激发态（TD-DFT），优化后的结果，里面有 ...

首先非常感谢师兄的指点！可小弟想表达的是我把师兄回复的第一点当中的高斯优化基态（DFT）这一步去掉了，直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算，结果是正常结束，激发态跃迁数据也有了，问题就是没有进行优化这一步，这样的数据是否可行呢~
赞一下 回复此楼
坚持
4楼2015-04-07 10:42:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by dkgmx at 2015-04-07 10:42:27
首先非常感谢师兄的指点！可小弟想表达的是我把师兄回复的第一点当中的高斯优化基态（DFT）这一步去掉了，直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算，结果是正常结束，激发态跃迁数据也有了，问题就是没有进行 ...

按说吸收，应该是分子从基态吸收，你说：‘直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算’。你的意思是，你是从s0做的td？如果是从s0做的td，应该没问题。但是如果你不能保证你做td的时候的结构是s0，那么这个td应该就没有意义吧。这事我的理解。不一定对。我比较水、
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

dkgmx
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
5楼2015-04-07 14:53:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dkgmx

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-04-07 14:53:53
按说吸收，应该是分子从基态吸收，你说：‘直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算’。你的意思是，你是从s0做的td？如果是从s0做的td，应该没问题。但是如果你不能保证你做td的时候的结构是s0，那么这个td ...

明白师兄的意思了，是要先优化使结构为基态S0，再做TD，这样吸收光谱才有意义，只是给不了分，送朵红花吧，谢谢啦！
赞一下 回复此楼
坚持
6楼2015-04-07 21:00:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by dkgmx at 2015-04-07 21:00:33
明白师兄的意思了，是要先优化使结构为基态S0，再做TD，这样吸收光谱才有意义，只是给不了分，送朵红花吧，谢谢啦！...

客气，共同交流学习
赞一下 回复此楼
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
7楼2015-04-08 07:30:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dkgmx 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 C79jjtjAKjEn 2026-09-15 3/150 2026-09-18 03:42 by cITaGg3p5edr
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 5BDX0d0WFp7t 2026-09-15 4/200 2026-09-18 03:18 by cITaGg3p5edr
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-18 00:28 by cITaGg3p5edr
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-17 23:28 by cuPZTDXS3VOd
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +5 23jxep3nCNZb 2026-09-14 5/250 2026-09-17 13:29 by ObVzqQQh1rrE
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 yaCh4X3wd045 2026-09-14 4/200 2026-09-17 13:17 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 4/200 2026-09-17 13:05 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 6/300 2026-09-17 12:29 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +8 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 8/400 2026-09-17 11:27 by UAIjTRMuUFoj
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 mibUvS8DDCwf 2026-09-15 4/200 2026-09-17 06:26 by k06BKNblrGRH
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 6/300 2026-09-17 02:38 by Tql5LQhh5rLK
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-17 02:38 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +7 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 8/400 2026-09-17 01:38 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 23jxep3nCNZb 2026-09-14 4/200 2026-09-16 21:03 by MHf40yA0Uhyb
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-16 19:15 by rRvxEj3zorCy
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-16 16:00 by i3KBRD19ERkG
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 5/250 2026-09-15 16:59 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +7 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 7/350 2026-09-15 16:23 by CgyNCDVNhGVg
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:26 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:38 by 5BDX0d0WFp7t
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭