应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 关于gaussianTD计算吸收光谱和优化问题
71/1返回列表
查看: 1553  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

dkgmx

木虫 (正式写手)

[求助] 关于gaussianTD计算吸收光谱和优化问题 已有1人参与

小弟先用分子动力学跑了小分子配体和DNA的体系，然后想用TD计算模拟小分子在DNA存在下的光谱，gaussian输入文件关键词为# oniom(B3LYP/6-31G(d,p) TD(nstates=100):amber)  scrf=pcm，运行之后正常结束，没有进行OPT这过程，请问这样的数据可行吗？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
坚持
1楼 2015-04-06 12:43:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
不加opt是吸收谱，加了opt是发射谱
赞一下 回复此楼
2楼2015-04-07 08:19:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)
我对分子动力学不太懂。我说说我高斯的理解。同时，你多多问一楼枪神，他懂得多。
1：高斯优化基态（DFT），然后基于基态做td，这叫吸收。做出来的谱叫吸收谱
2：高斯优化激发态（TD-DFT），优化后的结果，里面有个s1的波长，这叫做发射，做出来的谱线，叫做发射谱
以上是我的理解，不对之处还请指点，谢谢
赞一下 回复此楼
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
3楼2015-04-07 08:54:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dkgmx

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-04-07 08:54:42
我对分子动力学不太懂。我说说我高斯的理解。同时，你多多问一楼枪神，他懂得多。
1：高斯优化基态（DFT），然后基于基态做td，这叫吸收。做出来的谱叫吸收谱
2：高斯优化激发态（TD-DFT），优化后的结果，里面有 ...

首先非常感谢师兄的指点！可小弟想表达的是我把师兄回复的第一点当中的高斯优化基态（DFT）这一步去掉了，直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算，结果是正常结束，激发态跃迁数据也有了，问题就是没有进行优化这一步，这样的数据是否可行呢~
赞一下 回复此楼
坚持
4楼2015-04-07 10:42:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by dkgmx at 2015-04-07 10:42:27
首先非常感谢师兄的指点！可小弟想表达的是我把师兄回复的第一点当中的高斯优化基态（DFT）这一步去掉了，直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算，结果是正常结束，激发态跃迁数据也有了，问题就是没有进行 ...

按说吸收，应该是分子从基态吸收，你说：‘直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算’。你的意思是，你是从s0做的td？如果是从s0做的td，应该没问题。但是如果你不能保证你做td的时候的结构是s0，那么这个td应该就没有意义吧。这事我的理解。不一定对。我比较水、
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

dkgmx
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
5楼2015-04-07 14:53:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dkgmx

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 小范范1989 at 2015-04-07 14:53:53
按说吸收，应该是分子从基态吸收，你说：‘直接在分子动力学得到的构型做基于基态的TD计算’。你的意思是，你是从s0做的td？如果是从s0做的td，应该没问题。但是如果你不能保证你做td的时候的结构是s0，那么这个td ...

明白师兄的意思了，是要先优化使结构为基态S0，再做TD，这样吸收光谱才有意义，只是给不了分，送朵红花吧，谢谢啦！
赞一下 回复此楼
坚持
6楼2015-04-07 21:00:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小范范1989

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by dkgmx at 2015-04-07 21:00:33
明白师兄的意思了，是要先优化使结构为基态S0，再做TD，这样吸收光谱才有意义，只是给不了分，送朵红花吧，谢谢啦！...

客气，共同交流学习
赞一下 回复此楼
It doesn't matter how slow you are, as long as you're determined to get there, you'll get there.
7楼2015-04-08 07:30:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dkgmx 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历 +9 材料学257求调剂 2026-03-23 10/500 2026-03-24 07:36 by wangy0907
[考研] 求调剂 +7 十三加油 2026-03-21 7/350 2026-03-23 23:48 by 热情沙漠
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 一志愿上海交大生物与医药专硕324分，求调剂 +5 jiajunX 2026-03-22 5/250 2026-03-23 18:07 by YMU施老师
[考研] 0854电子信息求调剂 324 +3 Promise-jyl 2026-03-23 3/150 2026-03-23 13:43 by wangkm
[考研] 352求调剂 +3 大米饭！ 2026-03-22 3/150 2026-03-22 23:28 by king123！
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 4/200 2026-03-22 15:12 by 朱芷琳
[考研] 生物学调剂 +5 Surekei 2026-03-21 5/250 2026-03-22 14:39 by tcx007
[考研] 354求调剂 +7 Tyoumou 2026-03-18 10/500 2026-03-22 11:11 by 人来盛
[基金申请] 山东省面上项目限额评审 +4 石瑞0426 2026-03-19 4/200 2026-03-22 08:50 by Wei_ren
[考研] 考研调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 313求调剂 +4 肆叁贰壹22 2026-03-19 4/200 2026-03-21 17:33 by ColorlessPI
[基金申请] 学校已经提交到NSFC，还能修改吗？ 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 二本跨考郑大材料306英一数二 +3 z1z2z3879 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:29 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +3 晨昏线与星海 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:46 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 317求调剂 +5 申子申申 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:26 by JourneyLucky
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 生物学调剂招人！！！ +3 山海天岚 2026-03-17 4/200 2026-03-19 21:34 by 怎么释怀
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭