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pdb2gmx执行效率这么慢？
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| 各位大侠，我是刚刚开始学习gromacs. 我从网上找个简单的例子想学习一下整个模拟过程。找的例子是模拟水环境下的小肽链。资料上上说这个模拟大概10分钟就能完成。我下载了1F95.pdb文件，然后就执行pdb2gmx -f 1F95.pdb -o 1F95.gro -p 1F95.top > output.pdb2gmx命令，但是光这个命令就跑了10多个小时，还没有出结果，就是没有出现$>这样的提示输入新的指令。但是电脑资源管理器看CPU和内存的使用率都很低，我想请教一下这个指令就是要跑很久呢？还是我在ubuntu下装的gromacs有问题呢？请多多指教！不胜感激！ |
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