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fan728516414

银虫 (小有名气)

[求助] pyrx在运行 Run Autogrid 时出现了错误,怎么处理这个问题。 已有2人参与

如图所示。我是按教程来的。官方教程。0.8版本。为甚么出现下面的问题,怎么回事
在Python shell 里显示这些
Traceback (most recent call last):
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\wxMainFrame.py", line 304, in TryCommand
    retObject = command(*args, **kw)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\autogridPage.py", line 229, in TryRun
    self.processPanel.Start()
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\webServices.py", line 657, in Start
    resp = self.appServicePort.launchJob(self.req)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\AppService\AppService_client.py", line 58, in launchJob
    self.binding.Send(None, None, request, soapaction="http://nbcr.sdsc.edu/opal/launchJob", **kw)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\ZSI\client.py", line 291, in Send
    self.h.connect()
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\httplib.py", line 716, in connect
    self.timeout)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\socket.py", line 514, in create_connection
    raise error, msg
error: [Errno 10060]
Python 2.6.5 (r265:79096, Mar 19 2010, 21:48:26) [MSC v.1500 32 bit (Intel)] on win32
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\wxMainFrame.py", line 304, in TryCommand
    retObject = command(*args, **kw)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\autogridPage.py", line 229, in TryRun
    self.processPanel.Start()
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\webServices.py", line 657, in Start
    resp = self.appServicePort.launchJob(self.req)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\AppService\AppService_client.py", line 58, in launchJob
    self.binding.Send(None, None, request, soapaction="http://nbcr.sdsc.edu/opal/launchJob", **kw)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\ZSI\client.py", line 291, in Send
    self.h.connect()
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\httplib.py", line 716, in connect
    self.timeout)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\socket.py", line 514, in create_connection
    raise error, msg
error: [Errno 10060]
救救我吧。

pyrx在运行 Run Autogrid 时出现了错误,怎么处理这个问题。
QQ截图20150327103659.png


pyrx在运行 Run Autogrid 时出现了错误,怎么处理这个问题。-1
QQ截图20150327105240.png
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tooyoungtoosimple
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岸芷汀蓝冰

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 岸芷汀蓝冰 at 2015-03-29 17:30:12
而且配体的名字不能太长

把那个横杠去了试试,电脑关机没出现过啊!

[ 发自小木虫客户端 ]
用心做一切
4楼2015-03-30 20:34:52
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fan728516414: 金币+10, ★★★很有帮助, 路径怎么查看啊,是不是pyrx需要运行autodock和autogrid两个解压文件,这两个文件的安装路径一定要设置在pyrx的默认路径中。这两个文件哪来的。 2015-03-30 18:49:54
查看一下路径是否争取
2楼2015-03-29 10:32:03
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岸芷汀蓝冰

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fan728516414: 金币+10, 哪方面不能长,我这个长了吗?为什么vina可以运行呢。然后,我用笔记本运行计算了十来个,每次都是到第二个时电脑自动关机了,是不是电脑不行啊,只能一个一个算。 2015-03-30 18:51:54
而且配体的名字不能太长

[ 发自小木虫客户端 ]
用心做一切
3楼2015-03-29 17:30:12
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fan728516414

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 岸芷汀蓝冰 at 2015-03-30 20:34:52
把那个横杠去了试试,电脑关机没出现过啊!
...

哦 我试试,那个box参数怎么设置。在glg 里面吗?怎么找这个文件夹
tooyoungtoosimple
5楼2015-03-30 22:11:22
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