24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2003  |  回复: 4
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

fan728516414

银虫 (小有名气)

[求助] pyrx在运行 Run Autogrid 时出现了错误,怎么处理这个问题。 已有2人参与

如图所示。我是按教程来的。官方教程。0.8版本。为甚么出现下面的问题,怎么回事
在Python shell 里显示这些
Traceback (most recent call last):
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\wxMainFrame.py", line 304, in TryCommand
    retObject = command(*args, **kw)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\autogridPage.py", line 229, in TryRun
    self.processPanel.Start()
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\webServices.py", line 657, in Start
    resp = self.appServicePort.launchJob(self.req)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\AppService\AppService_client.py", line 58, in launchJob
    self.binding.Send(None, None, request, soapaction="http://nbcr.sdsc.edu/opal/launchJob", **kw)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\ZSI\client.py", line 291, in Send
    self.h.connect()
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\httplib.py", line 716, in connect
    self.timeout)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\socket.py", line 514, in create_connection
    raise error, msg
error: [Errno 10060]
Python 2.6.5 (r265:79096, Mar 19 2010, 21:48:26) [MSC v.1500 32 bit (Intel)] on win32
Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\wxMainFrame.py", line 304, in TryCommand
    retObject = command(*args, **kw)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\autogridPage.py", line 229, in TryRun
    self.processPanel.Start()
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\webServices.py", line 657, in Start
    resp = self.appServicePort.launchJob(self.req)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\PyRx\AppService\AppService_client.py", line 58, in launchJob
    self.binding.Send(None, None, request, soapaction="http://nbcr.sdsc.edu/opal/launchJob", **kw)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\site-packages\ZSI\client.py", line 291, in Send
    self.h.connect()
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\httplib.py", line 716, in connect
    self.timeout)
  File "C:\Program Files\PyRx\lib\socket.py", line 514, in create_connection
    raise error, msg
error: [Errno 10060]
救救我吧。

pyrx在运行 Run Autogrid 时出现了错误,怎么处理这个问题。
QQ截图20150327103659.png


pyrx在运行 Run Autogrid 时出现了错误,怎么处理这个问题。-1
QQ截图20150327105240.png
回复此楼
tooyoungtoosimple
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

岸芷汀蓝冰

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fan728516414: 金币+10, 哪方面不能长,我这个长了吗?为什么vina可以运行呢。然后,我用笔记本运行计算了十来个,每次都是到第二个时电脑自动关机了,是不是电脑不行啊,只能一个一个算。 2015-03-30 18:51:54
而且配体的名字不能太长

[ 发自小木虫客户端 ]
用心做一切
3楼2015-03-29 17:30:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

pymol

捐助贵宾 (正式写手)


【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fan728516414: 金币+10, ★★★很有帮助, 路径怎么查看啊,是不是pyrx需要运行autodock和autogrid两个解压文件,这两个文件的安装路径一定要设置在pyrx的默认路径中。这两个文件哪来的。 2015-03-30 18:49:54
查看一下路径是否争取
2楼2015-03-29 10:32:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

岸芷汀蓝冰

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 岸芷汀蓝冰 at 2015-03-29 17:30:12
而且配体的名字不能太长

把那个横杠去了试试,电脑关机没出现过啊!

[ 发自小木虫客户端 ]
用心做一切
4楼2015-03-30 20:34:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fan728516414

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 岸芷汀蓝冰 at 2015-03-30 20:34:52
把那个横杠去了试试,电脑关机没出现过啊!
...

哦 我试试,那个box参数怎么设置。在glg 里面吗?怎么找这个文件夹
tooyoungtoosimple
5楼2015-03-30 22:11:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 349求调剂 +4 李木子啊哈哈 2026-03-25 4/200 2026-03-26 22:49 by fmesaito
[考研] 求调剂 +5 芦lty 2026-03-25 6/300 2026-03-26 20:49 by 不吃魚的貓
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-26 19:57 by nihaoar
[考研] 286求调剂 +13 Faune 2026-03-21 13/650 2026-03-26 19:52 by peike
[考研] 化学工程085602 305分求调剂 +17 RichLi_ 2026-03-25 17/850 2026-03-26 19:44 by plmuchong
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 081700 调剂 267分 +11 迷人的哈哈 2026-03-23 11/550 2026-03-26 15:41 by zzll406
[考研] 321求调剂 +3 璞玉~~ 2026-03-25 3/150 2026-03-25 19:07 by Zhanglab-TJU
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 282求调剂 +3 wcq131415 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:16 by userper
[考研] 食品专硕 一志愿双一流 328 +3 xiaom99 2026-03-21 4/200 2026-03-24 21:20 by lailaisimei
[考研] 291求调剂 +3 HanBeiNingZC 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:34 by barlinike
[考研] 一志愿华东理工大学081700,初试分数271 +5 kotoko_ik 2026-03-23 6/300 2026-03-24 10:29 by 学术搬砖er
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 336求调剂 +4 收到VS 2026-03-20 4/200 2026-03-23 19:02 by macy2011
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 石河子大学(211、双一流)硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见