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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 差分电荷密度如何分析
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xiejiancqu

金虫 (初入文坛)

[求助] 差分电荷密度如何分析 已有1人参与

V2O5晶体中存在三种不同类型的氧，所以我想通过差分电荷密度图来看着三种类型的氧与钒原子的成键情况。
最近在学习用CASTEP计算V2O5晶体的差分密度；在网上也搜了相关的内容，但是还存在以下疑惑：
1、计算晶胞的出来的差分密度图显示不完整，所以我采用1x3x3（参考文献）的超胞计算（如下面的图）；
    请教：什么情况应该用超胞，超胞选取的大小的原则是什么呢？
2、计算得到的图是否正确请大家帮我看看：（其中灰色表示钒原子、红色表示氧原子）
    请教：切片位置没有切到相应的原子，而是处于键中间，那么图上对应的原子应该如何辨别；
               对于原子之间的成键情况，如何去分析？（图上的标尺显示蓝色为正，是表示得到电子吗？红色为负表示失去电子吗？）；用大家提供的方法在origin里面做出来的图标尺又没有正负之分了（所以对于得失电子的情况用虚实线表示我也就不知道了.....是对应MS计算的图吗？）
  
问题可能问的不是很到位，还望见谅！望各位前辈多多指教！在此非常感谢！

附：第一张图是用CASTEP计算的（不知是否正确）
      第二张图隐藏了原子
      第三张图用虫友提供的方法在origin稍稍处理了一下得到的图

差分电荷密度如何分析
差分密度-1.png


差分电荷密度如何分析-1
差分密度-2.png


差分电荷密度如何分析-2
差分密度-3.png
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差分电荷密度

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1楼 2015-03-26 11:39:17
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0Reliance

银虫 (正式写手)
★
蛋蛋小童鞋: 金币-1, 应助指数-1, 该回答不属于应助 2016-09-07 20:48:40
你好！请问你的第三章图 是怎么做出来的？我现在就想用origin一张这样的图！但是遇到了一些问题 一直没有办法解决！
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2楼2016-07-18 11:26:37
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bujiesan

新虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 0Reliance at 2016-07-18 11:26:37
你好！请问你的第三章图 是怎么做出来的？我现在就想用origin一张这样的图！但是遇到了一些问题 一直没有办法解决！

请问你解决了么？我也想做这样的图，但是遇到了很多问题，请问你第一张和第二张是怎么做的哇？能给个联系方式么？灰常感谢
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好好学物理！
3楼2016-07-18 11:38:13
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0Reliance

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by bujiesan at 2016-07-18 11:38:13
请问你解决了么？我也想做这样的图，但是遇到了很多问题，请问你第一张和第二张是怎么做的哇？能给个联系方式么？灰常感谢...

我用的是VASP前两张，我也不知道是怎么做出来的，你知道第三张是怎么做的吗？你说你扣扣吧！我的扣扣有权限，我自己都忘记设置的答案了！

发自小木虫Android客户端
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4楼2016-07-18 13:18:14
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bujiesan

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 0Reliance at 2016-07-18 13:18:14
我用的是VASP前两张，我也不知道是怎么做出来的，你知道第三张是怎么做的吗？你说你扣扣吧！我的扣扣有权限，我自己都忘记设置的答案了！
...

1124502567合作愉快

发自小木虫IOS客户端
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好好学物理！
5楼2016-07-18 13:55:11
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ball2006

铁杆木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 0Reliance at 2016-07-18 11:26:37
你好！请问你的第三章图 是怎么做出来的？我现在就想用origin一张这样的图！但是遇到了一些问题 一直没有办法解决！

第三张图您解决了吗？同样卡在相同的问题上了，求助啊啊啊！！！
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6楼2016-08-14 14:40:56
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
1、计算单胞就行，生成的密度网格可以做平移，ms中的display style中的field有个range可以调整，超胞算出来如果电荷密度不是单胞平移出来的，那就是程序有问题了；超胞的使用我个人认为如控制杂质、缺陷浓度，表面覆盖度，或者外推孤立杂质或者外推孤立分子吸附的情况才考虑的吧。

2、显示成等值面的形式岂不是很好？然后挑个能把你问题说明清楚的角度进行截图。
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不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
7楼2016-08-14 16:31:30
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daixiujuan52

铜虫 (正式写手)
一样的问题，楼主知道的话，给予分享啊，我用MS做出的图，但是不会分析。
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8楼2016-09-07 14:30:47
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