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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 量化新手直通车 » 如何导入Geometry (Cartesian Coordinates)数据
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linuxx

木虫 (著名写手)

[求助] 如何导入Geometry (Cartesian Coordinates)数据 已有2人参与

如何导入已经报道的Geometry (Cartesian Coordinates)数据？

数据整理过了，但还是没法导入到chembio3D 或是 gaussView，求助如何整理或导入？

具体数据看下面或附件。谢谢！

50
C        2.093436        1.234742        4.600467
C        2.747606        1.866061        3.532923
C        2.338958        1.678635        2.208173
C        1.248658        0.860982        1.936251
C        0.613099        0.236375        3.026521
C        1.008781        0.402643        4.358091
B        0.516245        0.329255        0.608768
N        −0.464418        −0.554819        2.667362
N        −0.590586        −0.571909        1.399049
C        −1.691776        −1.260651        0.852516
C        −1.746691        −1.487537        −0.531168
C        −2.819498        −2.163688        −1.079794
C        −3.863265        −2.624260        −0.262701
C        −3.811549        −2.395348        1.120634
C        −2.732580        −1.717987        1.669027
C        1.60122        −0.589854        −0.195273
C        −0.296861        1.450979        −0.254288
C        −0.969562        2.486026        0.401153
C        −1.661164        3.498127        −0.256839
C        −1.710525        3.497349        −1.645646
C        −1.077227        2.478289        −2.346085
C        −0.397069        1.485752        −1.646187
C        2.599029        0.047508        −0.935836
C        3.628922        −0.621526        −1.583714
C        3.705477        −2.007413        −1.485545
C        2.752849        −2.687054        −0.738958
C        1.736297        −1.973944        −0.105315
F        −0.987191        2.534745        1.743027
F        −2.279994        4.459944        0.431645
F        −2.369335        4.454039        −2.297119
F        −1.130922        2.453754        −3.679669
F        0.154335        0.517273        −2.401237
F        2.591266        1.389676        −1.041874
F        0.874177        −2.705700        0.62259
F        2.820023        −4.015553        −0.623097
F        4.685972        −2.672295        −2.095364
F        4.544474        0.048494        −2.286917
H        2.438211        1.39798        5.617566
H        3.592041        2.518457        3.742348
H        2.870461        2.176956        1.402494
H        0.48011        −0.106123        5.158779
H        −0.946550        −1.145239        −1.176500
H        −2.873865        −2.351450        −2.147269
H        −4.608670        −2.733497        1.77319
H        −2.688786        −1.532593        2.736314
O        −4.866362        −3.266210        −0.897063
C        −5.951403        −3.755085        −0.128333
H        −6.476605        −2.940436        0.385998
H        −6.629180        −4.228744        −0.839874
H        −5.618704        −4.498948        0.606441
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我思故我在
1楼 2015-03-26 02:00:33
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
linuxx: 金币+1, ★有帮助, 谢谢关注 2015-03-26 11:00:51
忘记能不能直接打开.xyz了
如果不能，那就用openbabel转格式

其实有xyz，改下就成com
gv就能打开了

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2楼2015-03-26 05:43:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

linuxx

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by qchem at 2015-03-26 05:43:07
忘记能不能直接打开.xyz了
如果不能，那就用openbabel转格式

其实有xyz，改下就成com
gv就能打开了

原来没有什么格式，我自己做的xyz 文件，但是打不开，不知道什么问题，导入也不行.
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我思故我在
3楼2015-03-26 10:37:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qchem

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
linuxx: 金币+6, ★★★很有帮助 2015-04-10 19:17:10
引用回帖:
3楼: Originally posted by linuxx at 2015-03-26 10:37:11
原来没有什么格式，我自己做的xyz 文件，但是打不开，不知道什么问题，导入也不行....

你把50删了换成下面的
%chk=xxx.chk
#p b3lyp/6-31g(d) opt

title

0,1

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4楼2015-03-26 20:20:14
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by qchem at 2015-03-26 20:20:14
你把50删了换成下面的
%chk=xxx.chk
#p b3lyp/6-31g(d) opt

title

0,1
...

存成文本文件，后缀改为.com

[ 发自小木虫客户端 ]
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5楼2015-03-26 20:21:08
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gauss98

禁虫 (正式写手)
★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
linuxx: 金币+3, ★★★很有帮助 2015-04-10 19:17:29
本帖内容被屏蔽
6楼2015-03-27 08:39:23
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