| 查看: 3333 | 回复: 104 | ||||||||
| 本帖产生 1 个 APEPI ，点击这里进行查看 | ||||||||
starseacow专家顾问 (职业作家)
|
[交流]
2015年3月starseacow文献分享 （总第25期）
|
|||||||
|
2015年3月starseacow文献分享 （总第25期） 这个月的文献分享姗姗来迟。 首先是一篇来自Nature的文章，与植物关系不大，但我比较感兴趣。 Nature. 2015 Feb 5;518(7537):61-7. doi: 10.1038/nature14148. Epub 2015 Jan 12. Mechanistic insights into the recycling machine of the SNARE complex. Zhao M, Wu S, Zhou Q, Vivona S, Cipriano DJ, Cheng Y, Brunger AT. 这篇文章讨论和SNARE相关的问题。SNARE在细胞中是一个蛋白家族，他们分布在细胞内膜系统上，当细胞内膜融合时，位于目标膜和转运泡膜上的SNARE蛋白相互作用，组成SNARE复合体，扭合在一起，促使膜融合。SNARE蛋白这种功能的动力来源是在解开SNARE复合体时，由NSF水解ATP获得的能量。NSF通过SNAP与SNARE接触并发挥作用。同时，这种基于NSF的复合体解开，也将SNARE蛋白释放出来用于下一次的膜融合。在这篇文章中，作者研究了NSF-SNAP-SNARE蛋白的结构，揭示SNARE从复合体状态中解开的具体过程，同时，作者证实了同一种NSF-SNAP系统可以用于不同的SNARE蛋白复合体解开。 接下来是两篇来自nature plant的文章，收回我之前对这个期刊的评价。 Protein turnover in plant biology Clark J. Nelson & A. Harvey Millar Nature Plants 1, Article number: 15017 (2015) 植物细胞内蛋白时刻处在一种动态更新中，这取决于植物对蛋白合成和降解系统的调控。这两个系统是怎样取得动态平衡的呢？这篇文章综述了近几年的相关研究成果，关注了一些环境因素对这种平衡的影响。 Touch-induced changes in Arabidopsis morphology dependent on gibberellin breakdown Nature Plants 1, Article number: 14025 (2015) Maria João Pimenta Lange & Theo Lange 这篇文章研究的是一种独特的非生物胁迫，接触（touch）。不断地物理触碰植物，会影响植物生长及推迟开花，传统研究认为这与茉莉酸信号相关，这篇文章发现这一效应也要求赤霉素参与。 The nutrient economy of Lodoicea maldivica, a monodominant palm producing the world's largest seed. New Phytol. 2015 Jan 23. doi: 10.1111/nph.13272. Edwards PJ, Fleischer-Dogley F, Kaiser-Bunbury CN. 这篇文章关注了一种很独特的植物，棕榈科的海椰子（Lodoicea maldivica），这种生长在贫瘠土地上的植物可以产生世界上最大的种子。这篇文章研究了这种植物对N和P的利用，发现它们将大量的N和P用于种子生成，远多于用于营养生长。这就要求这种植物产生一些独特的结构以增加营养吸收利用。在它的叶片上，有一些独特的结构可以拦截空气中的颗粒，譬如说某些花粉，在下雨的时候就可以将这些花粉冲到它的根系以作为营养来源。 植物界，很奇妙。  images.jpg |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 《读懂天然产物系列》 | 生物工程 | starseacow 文献分享 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
wangkaibo123» 猜你喜欢
江苏省优青门槛
已经有20人回复
-
心好累。今年我们部门提交了18个项目。中了11了，可惜我的又挂了
已经有10人回复
-
植物学论文润色/翻译怎么收费?
已经有187人回复
-
面上项目计划书
已经有7人回复
-
面上项目计划书附件
已经有9人回复
-
面上项目计划书系统状态
已经有18人回复
-
NSFC-UNEP（与联合国环境规划署）合作项目
已经有33人回复
-
和伊朗人合作
已经有32人回复
-
江苏省自然基金
已经有7人回复
-
生命科学新英文普刊《INVESTIGATION OF LIFE SCIENCE》
已经有9人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 公派读博士一定要硕士毕业吗？ ~2015年CSC或者全奖的交流下~
已经有18人回复
- starseacow文献分享（2014年1月 第16期）
已经有102人回复
- starseacow文献阅读分享（第13期 2013-9）
已经有49人回复
- starseacow文献阅读分享（第11期 2013-6）
已经有79人回复
- starseacow文献阅读分享（第7期 2013-1）
已经有109人回复
- starseacow文献阅读分享（第2期 2012年8月23日）
已经有219人回复
- starseacow的文献分享 2012年8月16日
已经有327人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
江西科师大招收与湖南大学联合培养学硕1名
+1/496
-
延安大学接收化学与化工学院接收调剂生（化学、化工学硕和材料与化工专硕）
+2/138
-
招化学相关专业硕士调剂生
+1/88
-
西安电子科技大学通信工程学院招收 “非全日制 调剂生“
+2/74
-
扬州大学动物科学与技术学院李碧春教授课题组硕士研究生调剂招生 招生专业： 畜牧学
+1/38
-
吉大生科博一博士联培自荐-已发表+在投一作SCI3篇-踏实肯干能加班
+1/21
-
26申博自荐（新能源电池方向）
+1/21
-
大连工业大学 高分子材料 接收考研调剂
+1/19
-
【上海调剂】985联合培养！别错过能送你去丹麦/交大/同济/中科院的神仙导师！
+1/9
-
南通大学-交通与土木工程学院 招调剂学生
+1/8
-
Top-88悉尼科技大学数据科学/AI 招收2027年入学 校奖 博士生1到2名(国际和本地学生）
+1/5
-
杭州师范大学-浙江省湿地智慧监测与生态修复重点实验室团队硕士调剂公告
+1/5
-
贵州财经大学新一代电子信息技术（含量子技术等）硕士专业（085401）接收调剂
+1/5
-
山西大学招收2026级申请考核制化学材料类博士研究生一名
+1/4
-
河南城建学院招收土木与水利、资源与环境调剂生
+1/3
-
上海应用技术大学化工学部招生调剂
+1/3
-
差旅首选:第一次出差佛山开住宿餐饮发票实体店电子专用,保姆级教程请收好
+1/2
-
齐鲁工业大学轻工学部 招收材料与化工调剂
+1/2
-
2026年河北大学材料与化工（专硕）调剂和化学生物学学硕调剂
+1/1
-
2026 中科院山西煤化所 国重室616组 特别研究助理招聘
+1/1
starseacow
专家顾问 (职业作家)
-
专家经验: +426 - APEPI: 64
- 应助: 1217 (讲师)
- 金币: 9097.3
- 帖子: 4669
- 在线: 2320.2小时
- 虫号: 1136974
|
接下来分享一篇PLANT CELL上的文章，为了便于理解，我将这篇文章之前工作发表的论文也列出来。 Arabidopsis Sec1/Munc18 protein SEC11 is a competitive and dynamic modulator of SNARE binding and SYP121-dependent vesicle traffic. Karnik R, Grefen C, Bayne R, Honsbein A, Köhler T, Kioumourtzoglou D, Williams M, Bryant NJ, Blatt MR. Plant Cell. 2013 Apr;25(4):1368-82 Binding of SEC11 Indicates Its Role in SNARE Recycling after Vesicle Fusion and Identifies Two Pathways for Vesicular Traffic to the Plasma Membrane Rucha Karnik, Ben Zhang, Sakharam Waghmare, Christin Aderhold, Christopher Grefen, Michael R Blatt The Plant Cell doi: http://dx.doi.org/10.1105/tpc.114.134429 这两篇文章主要探讨的是SEC11蛋白在调节SNARE蛋白功能中的作用。正如上面的帖子里提到，位于目标膜和转运泡膜上的SNARE蛋白相互结合结成复合体促进膜融合。而SEC11，是Sec1/Munc18家族的蛋白，这种蛋白也在细胞内囊泡运输及膜融合中发挥作用。这两篇文章解释的就是这种作用是什么。 第一篇文章（2013）中运用pull-down及BiFC技术，证明SEC11可以直接和SNARE家族中的一员SYP121发生直接相互作用。同时，为了研究这种相互作用对细胞内运输的影响，作者利用了一种traffic rescue技术。这种技术是在植物细胞内表达secYFP（一种会从ER分泌到膜外的荧光蛋白）以及作为参照的GFP。同时过表达要研究的目的蛋白。正常情况下，secYFP会被分泌到胞外，因此在细胞内只能看到GFP信号。如果过表达的目的蛋白干扰了囊跑运输，secYFP就会被截留在细胞内，因此可以看到YFP信号。通过YFP与GFP信号比值，可以获得一个参数表征细胞内转运情况。该比值升高，意味着正常运输被干扰，即traffic block，若比值降低，则意味着运输恢复，称为traffic rescue。结合这个技术，这篇文章证实SEC11参与调节SYP121参与的囊泡运输，同时SEC11 既可以与单独存在的SYP121发生相互作用以保证它处于未激活状态，避免不需要的SNARE蛋白复合体形成，同时，在SNARE形成复合体后，可以与复合体发生相互作用以稳定复合体的存在（结论在下面的cartoon里展示出来）。  图片2.jpg 第二篇文章是基于第一篇进行的深入研究。在拟南芥中，存在着63个SNARE蛋白，其中一些蛋白之间功能高度相似，譬如位于细胞膜上的SYP121\SYP122，位于转运泡上的VAMP721\VAMP722。那么，植物细胞是怎么选择哪对蛋白组成复合体呢？这篇文章利用前面提到的pull-down，BiFC以及基于酵母的mbSUS技术，研究了蛋白相互作用及复合体形成，利用traffic rescue技术展示不同蛋白过表达对细胞转运的影响。在syp121及syp122敲除突变体植物上进行研究。发现SEC11选择性的与SYP121而不是SYP122结合，以促进正确的SNARE复合体形成，同时，在该复合体解开时，SEC11也发挥了重要的作用。（这篇文章巨复杂，就像下面贴出来的总结cartoon里展示的，所以细节就不赘述了，感兴趣的虫友可以自己去看看）  图片1.jpg |
2楼2015-03-22 00:22:34
starseacow
专家顾问 (职业作家)
-
专家经验: +426 - APEPI: 64
- 应助: 1217 (讲师)
- 金币: 9097.3
- 帖子: 4669
- 在线: 2320.2小时
- 虫号: 1136974
4楼2015-03-22 00:23:29
7楼2015-03-22 00:30:04
简单回复
2015-03-22 00:23
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
dmbb5楼
2015-03-22 00:28
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
2015-03-22 00:29
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
2015-03-22 00:33
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
2015-03-22 00:39
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
jixiangbao10楼
2015-03-22 00:43
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
zhchzhsh207611楼
2015-03-22 00:48
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
秦士武阳12楼
2015-03-22 01:01
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
祝福
紫光麒麟13楼
2015-03-22 01:17
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
祝福
syhorchid14楼
2015-03-22 01:18
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
炼狱之火15楼
2015-03-22 01:24
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
youngen16楼
2015-03-22 01:47
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
robby200617楼
2015-03-22 01:56
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
xhmaohan18楼
2015-03-22 01:58
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
springburn19楼
2015-03-22 02:11
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
lilyshuoxu20楼
2015-03-22 04:31
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
hydzp21楼
2015-03-22 05:21
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
销衣00722楼
2015-03-22 06:00
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
b [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
lilyjun23楼
2015-03-22 06:23
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
～
123wgh45624楼
2015-03-22 06:36
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
tzynew25楼
2015-03-22 06:38
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
zbdfwq577726楼
2015-03-22 06:42
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
流云喵喵27楼
2015-03-22 06:44
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
猫猫家族28楼
2015-03-22 06:58
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
我是路人29楼
2015-03-22 07:02
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
wfnic30楼
2015-03-22 07:09
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
至贱无敌31楼
2015-03-22 07:34
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
yumoym32楼
2015-03-22 07:43
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
1
ma-yue33楼
2015-03-22 08:04
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
假大空34楼
2015-03-22 08:09
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
gltsycw35楼
2015-03-22 08:12
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
dengxuan199336楼
2015-03-22 08:13
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
kmustliuhx37楼
2015-03-22 08:14
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
ashlink38楼
2015-03-22 08:23
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
shcj39楼
2015-03-22 08:24
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
readytogo40楼
2015-03-22 08:24
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
gengxin6041楼
2015-03-22 08:25
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
祝福
nono200942楼
2015-03-22 08:26
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
脆卷旺43楼
2015-03-22 08:27
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
qianys44楼
2015-03-22 08:33
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
cqwhch45楼
2015-03-22 08:50
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
mtw92246楼
2015-03-22 08:54
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
lyf185047楼
2015-03-22 09:06
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
祝福 祝福
sz_kebaoyuan48楼
2015-03-22 09:06
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
小木鸭49楼
2015-03-22 09:13
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
1508279445650楼
2015-03-22 09:14
回复
starseacow(金币+1): 谢谢参与
