| 查看: 906 | 回复: 5 | ||
[求助]
急，求助 the all-atom CHARMM27 force field 是否适用于无水环境已有1人参与
|
| 各位虫友，求帮忙。我的MD模拟中有一部分是探究水分子存在对体系的影响，因此利用自编脚本将体系中的水分子去除了。但是现在有一个问题是，现在多数力场都是针对溶剂相的，不知我所用的这个charmm27力场是否可以同样应用在这个无水体系中呢？求虫友指点，或者有相关文献也可以啊，临近毕业需要解决这个问题，多谢多谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
垃圾破二本职称评审标准
已经有5人回复
-
三无产品还有机会吗
已经有4人回复
-
投稿返修后收到这样的回复，还有希望吗
已经有7人回复
-
压汞仪和BET测气凝胶孔隙率
已经有4人回复
-
博士申请都是内定的吗？
已经有14人回复
-
谈谈两天一夜的“延安行”
已经有13人回复
-
氨基封端PDMS和HDI反应快速固化
已经有11人回复
-
之前让一硕士生水了7个发明专利，现在这7个获批发明专利的维护费可从哪儿支出哈？
已经有11人回复
-
论文投稿求助
已经有4人回复
-
Applied Surface Science 这个期刊。有哪位虫友投过的能把word模板发给我参考一下嘛
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- gromacs中的oplsaa是什么版本，2001or2005
已经有6人回复
2楼2015-03-18 08:39:00
polypro
木虫 (正式写手)
- 应助: 197 (高中生)
- 金币: 3921.3
- 散金: 160
- 红花: 22
- 帖子: 512
- 在线: 62.6小时
- 虫号: 1809438
- 注册: 2012-05-11
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
yylcx
3楼2015-03-18 08:54:59
4楼2015-03-18 14:19:25
polypro
木虫 (正式写手)
- 应助: 197 (高中生)
- 金币: 3921.3
- 散金: 160
- 红花: 22
- 帖子: 512
- 在线: 62.6小时
- 虫号: 1809438
- 注册: 2012-05-11
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yylcx: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-03-18 18:27:03
yylcx: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-03-18 18:27:03
|
CHARMM力场的原始文献有清晰表述，Brooks BR, Brooks CL, Mackerell AD, Nilsson L, Petrella RJ, Roux B, Won Y, Archontis G, Bartels C, Boresch S, Caflisch A, Caves L, Cui Q, Dinner AR, Feig M, Fischer S, Gao J, Hodoscek M, Im W, Kuczera K, Lazaridis T, Ma J, Ovchinnikov V, Paci E, Pastor RW, Post CB, Pu JZ, Schaefer M, Tidor B, Venable RM, Woodcock HL, Wu X, Yang W, York DM, & Karplus M CHARMM: The Biomolecular Simulation Program. J. Comput. Chem. 2009, 30(10):1545-1614. |
5楼2015-03-18 14:50:43
6楼2015-03-18 18:26:51