| 查看: 965 | 回复: 5 | ||
[求助]
急，求助 the all-atom CHARMM27 force field 是否适用于无水环境 已有1人参与
|
| 各位虫友，求帮忙。我的MD模拟中有一部分是探究水分子存在对体系的影响，因此利用自编脚本将体系中的水分子去除了。但是现在有一个问题是，现在多数力场都是针对溶剂相的，不知我所用的这个charmm27力场是否可以同样应用在这个无水体系中呢？求虫友指点，或者有相关文献也可以啊，临近毕业需要解决这个问题，多谢多谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
酰胺脱乙酰基
已经有13人回复
-
有院领导为了换新车，用横向课题经费买了俩车
已经有8人回复
-
博士延得我，科研能力直往上蹿
已经有8人回复
-
同年申请2项不同项目，第1个项目里不写第2个项目的信息，可以吗
已经有4人回复
-
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有10人回复
-
天津大学招2026.09的博士生，欢迎大家推荐交流（博导是本人）
已经有5人回复
-
CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生｜MSCA经费充足、排名优
已经有6人回复
-
面上项目申报
已经有3人回复
-
遇见不省心的家人很难过
已经有22人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- gromacs中的oplsaa是什么版本，2001or2005
已经有6人回复
2楼2015-03-18 08:39:00
polypro
木虫 (正式写手)
- 应助: 197 (高中生)
- 金币: 3921.3
- 散金: 160
- 红花: 22
- 帖子: 512
- 在线: 62.6小时
- 虫号: 1809438
- 注册: 2012-05-11
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
yylcx
3楼2015-03-18 08:54:59
4楼2015-03-18 14:19:25
polypro
木虫 (正式写手)
- 应助: 197 (高中生)
- 金币: 3921.3
- 散金: 160
- 红花: 22
- 帖子: 512
- 在线: 62.6小时
- 虫号: 1809438
- 注册: 2012-05-11
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
yylcx: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-03-18 18:27:03
yylcx: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-03-18 18:27:03
|
CHARMM力场的原始文献有清晰表述，Brooks BR, Brooks CL, Mackerell AD, Nilsson L, Petrella RJ, Roux B, Won Y, Archontis G, Bartels C, Boresch S, Caflisch A, Caves L, Cui Q, Dinner AR, Feig M, Fischer S, Gao J, Hodoscek M, Im W, Kuczera K, Lazaridis T, Ma J, Ovchinnikov V, Paci E, Pastor RW, Post CB, Pu JZ, Schaefer M, Tidor B, Venable RM, Woodcock HL, Wu X, Yang W, York DM, & Karplus M CHARMM: The Biomolecular Simulation Program. J. Comput. Chem. 2009, 30(10):1545-1614. |
5楼2015-03-18 14:50:43
6楼2015-03-18 18:26:51