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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » Castep 表面吸附 能否利用对称性计算?
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NCEPUSCR

铁虫 (小有名气)

[求助] Castep 表面吸附 能否利用对称性计算? 已有2人参与

大家好,小弟在利用Castep计算小分子在氧化物表面的吸附.
在对切割表面进行几何优化时出现了问题:
如果利用对称性计算,优化速度会比较快,但是在添加吸附分子时候由于对称性的原因,原计划添加一个分子,结果却变成了两层分子,破坏了覆盖度;但是如果不利用对称性,计算就会很慢很慢.....
究竟该怎么办呢?求高人指点~
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1楼 2015-03-12 13:37:43
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
NCEPUSCR: 金币+20, ★★★很有帮助 2015-03-13 19:59:55
NCEPUSCR: 金币+10 2015-03-15 09:40:56
可以先比较一下，利用和不利用对成性的结算结果，如果一致，就采用对称性无妨。
如果利用对称性时，无法构建出期望的模型，就放弃对称性，计算得慢点就慢点。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2015-03-12 13:52:50
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@Ellete-blue

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
NCEPUSCR: 金币+10, ★有帮助 2015-03-13 19:56:18
在优化吸附之前先优化表面，这时候你可以用对称性。优化完表面后再添加吸附分子，不用对称性再优化。
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3楼2015-03-13 11:34:13
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NCEPUSCR

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by @Ellete-blue at 2015-03-13 11:34:13
在优化吸附之前先优化表面，这时候你可以用对称性。优化完表面后再添加吸附分子，不用对称性再优化。

谢谢指点,先送您10个金币吧~
恳请您再说说这么做的理由,好么?谢谢!
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4楼2015-03-13 19:58:25
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NCEPUSCR

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-03-12 13:52:50
可以先比较一下，利用和不利用对成性的结算结果，如果一致，就采用对称性无妨。
如果利用对称性时，无法构建出期望的模型，就放弃对称性，计算得慢点就慢点。

谢谢您的指点~
小弟在计算的时候结果虽然最终收敛了，但是中间波动很大，而且能量曲线也出现了一个波峰。这样的计算结果可信么？还是根本无效。。。（之前有看到先关计算的曲线都是一直向下收敛的。。。）恳请前辈再指点一下，谢谢！
附件里是计算的曲线~
Castep 表面吸附 能否利用对称性计算?
能量曲线2.PNG


Castep 表面吸附 能否利用对称性计算?-1
优化曲线1.PNG
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5楼2015-03-13 20:21:10
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月只蓝

主管区长 (职业作家)
引用回帖:
5楼: Originally posted by NCEPUSCR at 2015-03-13 20:21:10
谢谢您的指点~
小弟在计算的时候结果虽然最终收敛了，但是中间波动很大，而且能量曲线也出现了一个波峰。这样的计算结果可信么？还是根本无效。。。（之前有看到先关计算的曲线都是一直向下收敛的。。。）恳请前辈 ...

从图上来看，能量尽管波动，但最终达到了你设定的收敛指标。
即便是始终趋于收敛的能量曲线，也不一定说是可靠。用CASTEP作计算，参数设置非常重要，如果你的体系有文献做过，引用文献参数设置即可，如果没有，得自己做精确性测试和收敛性测试。具体见淡江大学李明宪老师CASTEP讲义。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
6楼2015-03-13 22:09:32
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NCEPUSCR

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 月只蓝 at 2015-03-13 22:09:32
从图上来看，能量尽管波动，但最终达到了你设定的收敛指标。
即便是始终趋于收敛的能量曲线，也不一定说是可靠。用CASTEP作计算，参数设置非常重要，如果你的体系有文献做过，引用文献参数设置即可，如果没有，得 ...

谢谢版主指点,照您的建议我去查阅了李明宪老师的讲义,但是还是没搞明白具体该怎么操作.....
我模拟的是原子和分子在氧化物表面的吸附.那么我的收敛性测试是该对添加吸附物的表面进行呢?还是该对干净表面进行呢?而且,同一个氧化物表面,以后每换一种吸附物质都要进行收敛性测试吗?求指点,谢谢!
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7楼2015-03-15 09:38:37
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