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sydtyx

铜虫 (正式写手)

[求助] 小分子结构优化,OPT=calcall或calcfc参数用和不用有什么差异?哪个结果更准确?已有1人参与

小分子结构优化时,OPT=calcall或calcfc参数,用与不用有什么差异?哪个结果更准确?
另外,如何判断或者保证优化结果是全局能量极小点?

请大侠们给个解答吧,谢谢啦!
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youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2015-03-06 06:23:03
sydtyx: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 谢谢! 2015-03-10 08:52:16
calcall更准确,calcall是在每一步优化的过程中都精确计算海森矩阵,而calcfc是指在优化的一开始精确计算海森矩阵,前者虽然准确,但是耗时长。对于全局最小值的获得,一般都是获得所有的局部最小值之后,比较能量,最小的一个就为全局最小值,或者是根据化学尝试去设计判断。用calcall和calcfc只能保证每个全局最小值更精确,这在消除虚频的时候比较管用。
平生多磨砺,男儿自横行!
2楼2015-03-06 00:32:21
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sydtyx

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by youyno at 2015-03-06 00:32:21
calcall更准确,calcall是在每一步优化的过程中都精确计算海森矩阵,而calcfc是指在优化的一开始精确计算海森矩阵,前者虽然准确,但是耗时长。对于全局最小值的获得,一般都是获得所有的局部最小值之后,比较能量, ...

我测试过一个简单情况,就是马菲琳结构,如果把它调到船式结构,不加calcall 参数,只用6-31G**优化,可以得到更稳定的椅式构象,但是加了calcall后,结果仍是船式构象?这样看来岂不是加了calcall更局限了?
3楼2015-03-10 08:49:15
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sydtyx

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by youyno at 2015-03-06 00:32:21
calcall更准确,calcall是在每一步优化的过程中都精确计算海森矩阵,而calcfc是指在优化的一开始精确计算海森矩阵,前者虽然准确,但是耗时长。对于全局最小值的获得,一般都是获得所有的局部最小值之后,比较能量, ...

另外,如何能找到所有局部最小点,然后再比较出全局最小点?Gaussian好像无法实现啊?
4楼2015-03-10 08:51:09
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youyno

银虫 (正式写手)

现在应该没有那个程序说能直接根据你提供的结构一定能找到全局最小值,除非是那些简单的,可以准确画出势能面的体系。一般如果正常优化能够达到你想要的结果就没有必要用calcall
平生多磨砺,男儿自横行!
5楼2015-03-10 10:36:03
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chenxin1992

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by sydtyx at 2015-03-10 08:49:15
我测试过一个简单情况,就是马菲琳结构,如果把它调到船式结构,不加calcall 参数,只用6-31G**优化,可以得到更稳定的椅式构象,但是加了calcall后,结果仍是船式构象?这样看来岂不是加了calcall更局限了?...

你那个船式构象很浅的势能面都能被搜索出来,正是说明calcall的精准性。如果你初猜在椅式构象附近,我想一定优化成椅式。

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2015-03-11 23:27:46
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chenxin1992

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sydtyx at 2015-03-10 08:51:09
另外,如何能找到所有局部最小点,然后再比较出全局最小点?Gaussian好像无法实现啊?...

嗯,无法实现。你需要用分子动力学的方法做。

[ 发自小木虫客户端 ]
7楼2015-03-11 23:28:48
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