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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » VASP projected wavefunction問題
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skydark

木虫 (正式写手)

[求助] VASP projected wavefunction問題已有1人参与

VASP 算 projected wavefunction ( 把某K點某條band的 wave function projected 到每顆原子的每個orbital)
然後把projected wavefunction 的數據寫在 PROCAR裏

但我覺得VASP算出?淼膒rojected wavefunction 數據不是很準,
例如我的系統是有對秤性的
但有時候VASP給出的數據完全沒有對秤性

不知道有什麼方法可以解決這問題呢?
在INCAR裏調什麼設定可以解決這問題?

希望各位高手不吝指教  
謝謝!
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1楼2015-02-27 16:50:22
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卡开发发

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Ab Initio Amateur
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。。 2015-03-16 21:57:10
引用回帖:
7楼: Originally posted by skydark at 2015-03-06 17:21:57
非常感謝你花那麼多時間幫我解困

我想問 如果是plane wave 所導致的問題
那有沒有辦法不用 plane wave 去算 而轉用其他更精準的算法?

另外我這兩天試過你的提議 在INCAR 設 LORBIT = 2
但設LORBIT = 2  ,  ...

LORBIT=2應該要指定WS半?桨桑蚁隤ROCAR當中沒有出現資料應該是這個原因。對稱性的原因我也不是很明瞭，也許如JPChou前輩說的那樣，是PAW本身的問題，似乎有點複雜。
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8楼2015-03-06 23:22:47
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jpchou

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★
franch: 金币+3, 谢谢回帖交流。。。。 2015-03-16 21:56:35
引用回帖:
7楼: Originally posted by skydark at 2015-03-06 17:21:57
非常感謝你花那麼多時間幫我解困

我想問 如果是plane wave 所導致的問題
那有沒有辦法不用 plane wave 去算 而轉用其他更精準的算法?

另外我這兩天試過你的提議 在INCAR 設 LORBIT = 2
但設LORBIT = 2  ,  ...

就如同卡开发发所言，LORBIT=2 要搭配 RWIGS
請看手冊 http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/LORBIT.html

PAW method 跟 plane wave 這是兩回事
一個方法可以簡單的確認是否是是 PAW 造成的問題
就是用 ultrasolf pseudopotential
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp ... h_VASP_package.html
可以試看看....
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9楼2015-03-06 23:59:29
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卡开发发

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Ab Initio Amateur
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franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。。 2015-03-16 21:57:27
引用回帖:
10楼: Originally posted by skydark at 2015-03-07 18:09:58
請問 WS 半?绞�  RWIGS 嗎?
但我設定RWIGS後仍沒出現PROCAR...........

這是我算自洽時的INCAR:


   ISTART =      0;   job: 0-new 1-cont 2-samecut
   ICHARG =      2;   Charge:  1-file 2-atom  10 ...

Lorbit=2似乎给出的是proout文件，你看看有没有。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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11楼2015-03-07 21:40:18
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卡开发发

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Ab Initio Amateur
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。。 2015-03-16 21:57:38
引用回帖:
12楼: Originally posted by skydark at 2015-03-07 22:28:09
PROCAR 跟 PROOUT都沒   但計算有確定完成?K且有收斂...

額，不好意思，LORBIT=2需要指定NPAR=1。
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13楼2015-03-08 04:40:44
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。。 2015-03-16 21:56:45
有沒有對稱跟POTCAR無關
主要是由 POSCAR 決定
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2楼2015-03-03 16:04:00
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skydark

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jpchou at 2015-03-03 16:04:00
有沒有對稱跟POTCAR無關
主要是由 POSCAR 決定

不是POTCAR 啦
是PROCAR  , output檔--PROCAR
PROCAR裏有記載Projected wave function

例如這樣:
ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2
  1  1.791  1.943  2.096  1.166  1.004  1.002  0.964  1.020  0.909
  1  1.883  2.113  2.066  1.581  0.993  0.996  0.985  1.011  0.953
  2  0.212 -0.058 -0.100 -0.832 -0.004  0.002  0.035  0.020  0.091
  2  0.098  0.113 -0.034 -0.432  0.007 -0.004  0.021  0.009  0.046
  3 -0.212 -0.058 -0.100 -0.832  0.004 -0.002 -0.035 -0.020 -0.091
  3 -0.098  0.113 -0.034 -0.432 -0.007  0.004 -0.021 -0.009 -0.046
  4  2.209  1.943  2.096  1.166  0.996  0.998  1.036  0.980  1.091
  4  2.117  2.113  2.066  1.581  1.007  1.004  1.015  0.989  1.046

但這顯然是沒算準的
不只對稱性沒有了  而且有好幾個數值都超過1了.........
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3楼2015-03-03 18:40:02
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jpchou

专家顾问 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
skydark: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2015-03-27 00:37:32
喔喔喔
眼花~把 PROCAR 看成 POTCAR......................


我想~ projected wave function 對稱性消失這件事
應該不是這麼容易發生..
比方我手邊有的 diamond bulk example
在 OUTCAR 內可以看到 Td symmetry
PROCAR 內也會出現很漂亮的 symmetry

gamma point
band   1 # energy  -11.71964967 # occ.  2.00000000

ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2    tot
  1  0.279  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.279
  2  0.279  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.279
tot  0.558  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.558

band   2 # energy    9.85270879 # occ.  2.00000000

ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2    tot
  1  0.000  0.127  0.127  0.127  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.380
  2  0.000  0.127  0.127  0.127  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.380
tot  0.000  0.254  0.254  0.254  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.761

band   3 # energy    9.85381570 # occ.  2.00000000

ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2    tot
  1  0.000  0.190  0.000  0.190  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.380
  2  0.000  0.190  0.000  0.190  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.380
tot  0.000  0.380  0.000  0.380  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.761

band   4 # energy    9.85381989 # occ.  2.00000000

ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2    tot
  1  0.000  0.063  0.254  0.063  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.380
  2  0.000  0.063  0.254  0.063  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.380
tot  0.000  0.127  0.507  0.127  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.761

band   5 # energy   15.48420977 # occ.  0.00000000

ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2    tot
  1  0.000  0.100  0.100  0.100  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.299
  2  0.000  0.100  0.100  0.100  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.299
tot  0.000  0.199  0.199  0.199  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000  0.597
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4楼2015-03-03 22:04:31
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skydark

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by jpchou at 2015-03-03 22:04:31
喔喔喔
眼花~把 PROCAR 看成 POTCAR......................


我想~ projected wave function 對稱性消失這件事
應該不是這麼容易發生..
比方我手邊有的 diamond bulk example
在 OUTCAR 內可以看到 Td symm ...

兄臺  
你這unit cell只有兩顆原子  結構蠻簡單的
另外你這全都已經取絕對值
我的工作需要考慮Projected wave function的相位
所以我有開LORBIT =    12

我結構稍微複雜一點 有4顆原子
有些band還看得出對稱性
ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2
  1  0.132 -0.026  0.255  0.458  0.001  0.000  0.019  0.015  0.107
  1 -0.154 -0.022  0.044 -0.532  0.001  0.000 -0.022 -0.001 -0.124
  2 -0.132 -0.026  0.038  0.458 -0.001  0.000 -0.019  0.001 -0.107
  2  0.154 -0.023 -0.044 -0.532 -0.001 -0.001  0.022 -0.001  0.124
  3 -0.133  0.027 -0.038 -0.458 -0.001  0.000 -0.019  0.001 -0.107
  3  0.154  0.023  0.044  0.532 -0.001 -0.001  0.022 -0.001  0.124
  4  0.145  0.029  0.038 -0.457  0.003  0.000  0.019  0.001  0.107
  4 -0.154  0.022 -0.044  0.532  0.001  0.000 -0.022 -0.001 -0.124

有些band的對稱性卻消失了
ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2
  1  1.791  1.943  2.096  1.166  1.004  1.002  0.964  1.020  0.909
  1  1.883  2.113  2.066  1.581  0.993  0.996  0.985  1.011  0.953
  2  0.212 -0.058 -0.100 -0.832 -0.004  0.002  0.035  0.020  0.091
  2  0.098  0.113 -0.034 -0.432  0.007 -0.004  0.021  0.009  0.046
  3 -0.212 -0.058 -0.100 -0.832  0.004 -0.002 -0.035 -0.020 -0.091
  3 -0.098  0.113 -0.034 -0.432 -0.007  0.004 -0.021 -0.009 -0.046
  4  2.209  1.943  2.096  1.166  0.996  0.998  1.036  0.980  1.091
  4  2.117  2.113  2.066  1.581  1.007  1.004  1.015  0.989  1.046

以上是黑磷的例子
我有試過  不只是黑磷  連Bi2Se3也會出現這樣的錯誤
但band structure的圖卻不會跟文獻有太大的出入
我想知道是什麼原因會造成這樣的錯誤?
請問有辦法解決嗎?
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5楼2015-03-03 23:34:35
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jpchou

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★ ★
franch: 金币+4, 谢谢回帖交流。。。。 2015-03-16 21:57:02
引用回帖:
5楼: Originally posted by skydark at 2015-03-03 23:34:35
兄臺  
你這unit cell只有兩顆原子  結構蠻簡單的
另外你這全都已經取絕對值
我的工作需要考慮Projected wave function的相位
所以我有開LORBIT =    12

我結構稍微複雜一點 有4顆原子
有些band還看得出對 ...

相當有趣的問題
我剛試了一下黑磷，我所用的結構如下
P
1.0
        3.3099999428         0.0000000000         0.0000000000
        0.0000000000         4.3800001144         0.0000000000
       -1.6550205331         0.0000000000         5.2500124904
    P
    4
Selective Dynamics
Direct
     0.097999997         0.090000004         0.195999995   T   T   T
     0.902000010         0.909999967         0.804000020   T   T   T
     0.597999990         0.409999996         0.195999995   T   T   T
     0.402000010         0.590000033         0.804000020   T   T   T

其 symmetry 是 S2
的確在 PROCAR 中某些 band 有看到�?似的現像
ion      s     py     pz     px    dxy    dyz    dz2    dxz    dx2
  1 -0.463 -0.142  0.024 -0.200  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  1 -0.318 -0.097 -0.024  0.402  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  2 -0.276  0.264  0.158 -0.126  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  2  0.003 -0.069 -0.041 -0.296  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  3  0.477 -0.133 -0.004 -0.209  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  3 -0.288  0.118  0.010 -0.394  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  4 -0.201 -0.209  0.109  0.247  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000
  4 -0.176 -0.180  0.118 -0.199  0.000  0.000  0.000  0.000  0.000

網路上查了一下
找到了這些討論
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp ... phase+factors#p2114
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp ... phase+factors#p7271
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp ... hase+factors#p13654

看完後我的感覺是
可能是 LORBIT=12 所用的是 PAW 方法，造成如此現象
也許你可以試看看用 LORBIT = 2 也許可以改善


以前我有對 WAVECAR 作積分
積分結果其 NORM 理論上是要等於 1
但�?做結果不會是 1
結果總是很接近 1 ， 但永遠沒法變成 1
老闆是跟我說這是因為 PAW 方法的關係
詳情似乎很複雜~我就沒有繼續追下去
也許目前這情況也是因為 PAW 方法所造成
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6楼2015-03-04 07:06:32
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skydark

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jpchou at 2015-03-04 07:06:32
相當有趣的問題
我剛試了一下黑磷，我所用的結構如下
P
1.0
        3.3099999428         0.0000000000         0.0000000000
        0.0000000000         4.3800001144         0.0000000000
       -1. ...

非常感謝你花那麼多時間幫我解困

我想問 如果是plane wave 所導致的問題
那有沒有辦法不用 plane wave 去算 而轉用其他更精準的算法?

另外我這兩天試過你的提議 在INCAR 設 LORBIT = 2
但設LORBIT = 2  , PROCAR就會消失
PROCAR沒了  我就沒辦法看 projected wave function了........

PS : 我的VASP版本是5.X版的
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7楼2015-03-06 17:21:57
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skydark

木虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-03-06 23:22:47
LORBIT=2應該要指定WS半?桨桑蚁隤ROCAR當中沒有出現資料應該是這個原因。對稱性的原因我也不是很明瞭，也許如JPChou前輩說的那樣，是PAW本身的問題，似乎有點複雜。...

請問 WS 半?绞�  RWIGS 嗎?
但我設定RWIGS後仍沒出現PROCAR...........

這是我算自洽時的INCAR:


   ISTART =      0;   job: 0-new 1-cont 2-samecut
   ICHARG =      2;   Charge:  1-file 2-atom  10-const
   ISPIN  =      1    spin polarized calculation?
   NPAR   =      4
   LPLANE =   .TRUE.
   LSCALU =   .FALSE.
   LWAVE  =   .FALSE.
   NSIM   =    4
   LORBIT =    2
   RWIGS  =    1.217
   AMIN = 0.01
   BMIX = 0.0001
   AMIX_MAG =  0.1
   BMIX_MAG = 0.0001
   LSORBIT = .TRUE.
   SAXIS =  0 0 1   ! direction of the magnetic field
   GGA_COMPAT = .FALSE. ! apply spherical cutoff on gradient field

   ENMAX  =    500
   NELM   =    200;
   EDIFF  =   1E-8   stopping-criterion for ELM
   VOSKOWN = 1
   LMAXMIX = 4

   NSW    =      0    number of steps for IOM
   NBLOCK =      1;   KBLOCK =     40    inner block; outer block
   IBRION =      2    ionic relax: 0-MD 1-quasi-New 2-CG
   ISIF   =      2

   ISMEAR = -5; SIGMA = .20     broadening in eV -4-tet -1-fermi; 0-gaus


   IALGO  =     48
   LREAL  =      .TRUE.    real-space projection
   NBANDS  =  60
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10楼2015-03-07 18:09:58
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