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奉天大元帅

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2015-02-16 15:09:36
<Rij^2>是两点距离平方的平均值,<Rij>^2是两点距离平均的平方值,系综平均<>就是将所有任何两个原子之间遍历后求总和再除原子数,
编程思路是:
如果有N个原子,先做i=1:N的循环,,再j=1:N ...

版主你好,我也在算这个Lindemann指数,计算的是球形金属颗粒熔化过程,我是dump出atom文件,利用每个原子的相对坐标来计算这个指数,我的盒子是固定边界的,然后按照公式编写好了程序,自己也用几个简单的坐标试了下,结果没问题,但我有几点不是很清楚:1、<>表示的时间平均我就直接用每步输出的相对坐标代替计算了,这样可以吗?2、因为我用的相对坐标,当我改变整个盒子大小时候 得出的结果不一样,如何解决这样的问题?3、最后得出的Lindemann指数趋势跟文献相近,但是具体变化数值则相差2个数量级左右。4、文献中Lindemann曲线从0开始,我是实在想不出怎么能从0开始呢?
21楼2016-09-16 11:24:26
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abinitio

版主 (著名写手)

引用回帖:
21楼: Originally posted by 奉天大元帅 at 2016-09-16 11:24:26
版主你好,我也在算这个Lindemann指数,计算的是球形金属颗粒熔化过程,我是dump出atom文件,利用每个原子的相对坐标来计算这个指数,我的盒子是固定边界的,然后按照公式编写好了程序,自己也用几个简单的坐标试了 ...

我的理解应该还是用绝对座标吧。因为如果 是相对坐标,它的差值也是相对差值,和盒子大小有关。
比如 6-4=2
6/2-4/2=2/2=1

关于问题4,我想熔化都是从固态开始的,这时候原子位置相对固定,原地振动的值应该是0.随着温度上升,原子 的振动加强,lindemann参加开始增加。这应该是合理的。
22楼2016-09-18 10:59:24
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zenghuadong1

铜虫 (小有名气)

楼主,您好,能否贴出计算Lindemann index的脚本呢?谢谢
奋斗才有收获
23楼2017-11-21 16:11:26
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zenghuadong1

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2015-02-16 15:09:36
&lt;Rij^2&gt;是两点距离平方的平均值,&lt;Rij&gt;^2是两点距离平均的平方值,系综平均&lt;&gt;就是将所有任何两个原子之间遍历后求总和再除原子数,
编程思路是:
如果有N个原子,先做 ...

您好,能否贴出计算Lindemann index的脚本呢?谢谢
奋斗才有收获
24楼2017-11-21 16:12:16
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wjb2017

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
24楼: Originally posted by zenghuadong1 at 2017-11-21 16:12:16
您好,能否贴出计算Lindemann index的脚本呢?谢谢...

请问您是否做出了lindermann的图像呢?我是小白,想参考一下您的lammps的脚本,不知道是否可以,谢谢您!
25楼2017-12-18 19:49:57
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