24小时热门版块排行榜    

查看: 3943  |  回复: 24
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

维特的日记

木虫 (小有名气)

[求助] LAMMPS里模拟纳米团簇熔化时关于Lindemann指数的计算问题 已有1人参与

我在做一个金属纳米团簇熔化的模拟,由于需要Lidemann指数来判断熔点,lammps里没有现成的命令来计算把?感觉是不是要自己编程来算。。。
我对<Rij^2>和<Rij>^2不是很理解,在计算的时候怎么区别他们呢?怎样是先取了系综平均<>,我不知道用程序怎么实现他,希望研究过的各位前辈指点一下,谢谢哈!
提前祝大家新年快乐!

LAMMPS里模拟纳米团簇熔化时关于Lindemann指数的计算问题
0.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

维特的日记

木虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by abinitio at 2015-02-17 11:33:42
你说得对,我讲错了,是盒子大小。
比如,一个2D的,盒子大小是8,如果一个原子原始坐标是(8,8),由于运动和周期性边界条件,它的坐标可能会变为(1,1),如果按它xy各运动了7个单位,肯定是错误的,因为它在x和y ...

嗯嗯 明白了 就是说如果两个原子之间的距离大于盒子的一半 肯定会存在一个更近的原子 所以应该考虑更近的原子与它之间的距离
9楼2015-02-17 11:41:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 25 个回答

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
维特的日记: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-02-16 18:41:56
ben_ladeng: 金币+2, 谢谢指教 2015-02-16 19:33:20
维特的日记: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2015-02-17 18:09:36
<Rij^2>是两点距离平方的平均值,<Rij>^2是两点距离平均的平方值,系综平均<>就是将所有任何两个原子之间遍历后求总和再除原子数,
编程思路是:
如果有N个原子,先做i=1:N的循环,,再j=1:N-1
计算i原子为中心与原子j 的距离Rij=,此时要注意一下周期性边界条件
把所有的Rij累加,把所有Rij平方累加,然后除以总原子数
2楼2015-02-16 15:09:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

维特的日记

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2015-02-16 15:09:36
<Rij^2>是两点距离平方的平均值,<Rij>^2是两点距离平均的平方值,系综平均<>就是将所有任何两个原子之间遍历后求总和再除原子数,
编程思路是:
如果有N个原子,先做i=1:N的循环,,再j=1:N ...

谢谢你的回答!大体已经明白了,但是那个周期性边界要怎么处理呢,这个地方没怎么想明白
3楼2015-02-16 18:38:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 维特的日记 at 2015-02-16 18:38:50
谢谢你的回答!大体已经明白了,但是那个周期性边界要怎么处理呢,这个地方没怎么想明白...

如果在某一方向的位移值绝对值超过了晶格参数的一半,就将该方向的位移减或加上一个晶格参数,你想一下周期性边界条件的定义,就会理解了。
4楼2015-02-17 09:00:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 关于豆爷回答的JTJC与%2F数量 +5 yang182083 2026-08-06 7/350 2026-08-08 18:29 by zhanghaozhu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 4/200 2026-08-08 17:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 qTvzQBRAHjCi 2026-08-07 5/250 2026-08-08 17:02 by oEVWOejN9taj
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:47 by oEVWOejN9taj
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:42 by oEVWOejN9taj
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 6/300 2026-08-08 14:39 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 4/200 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 HEQlVqMTIA7d 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:27 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 KXLV3nuBVBY7 2026-08-07 5/250 2026-08-08 14:07 by oEVWOejN9taj
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +11 且听虎啸 2026-08-07 14/700 2026-08-08 12:50 by 布布和一二
[基金申请] 基金中了 +14 laoda193707 2026-08-06 14/700 2026-08-08 00:23 by 实验小白ha
[基金申请] 化学口download_prp&amp;fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode与中标关系的预测 +3 布布和一二 2026-08-07 3/150 2026-08-07 15:09 by gltch
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[基金申请] 8月时间戳变的,举个手。玩一下,释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 好消息?这个有何含义??? +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[基金申请] 什么时候能放榜呀? +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
请填处理意见