24小时热门版块排行榜    

查看: 4001  |  回复: 24
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

维特的日记

木虫 (小有名气)

[求助] LAMMPS里模拟纳米团簇熔化时关于Lindemann指数的计算问题 已有1人参与

我在做一个金属纳米团簇熔化的模拟,由于需要Lidemann指数来判断熔点,lammps里没有现成的命令来计算把?感觉是不是要自己编程来算。。。
我对<Rij^2>和<Rij>^2不是很理解,在计算的时候怎么区别他们呢?怎样是先取了系综平均<>,我不知道用程序怎么实现他,希望研究过的各位前辈指点一下,谢谢哈!
提前祝大家新年快乐!

LAMMPS里模拟纳米团簇熔化时关于Lindemann指数的计算问题
0.png
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

维特的日记

木虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by abinitio at 2015-02-17 11:33:42
你说得对,我讲错了,是盒子大小。
比如,一个2D的,盒子大小是8,如果一个原子原始坐标是(8,8),由于运动和周期性边界条件,它的坐标可能会变为(1,1),如果按它xy各运动了7个单位,肯定是错误的,因为它在x和y ...

嗯嗯 明白了 就是说如果两个原子之间的距离大于盒子的一半 肯定会存在一个更近的原子 所以应该考虑更近的原子与它之间的距离
9楼2015-02-17 11:41:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 25 个回答

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
维特的日记: 金币+10, ★★★很有帮助 2015-02-16 18:41:56
ben_ladeng: 金币+2, 谢谢指教 2015-02-16 19:33:20
维特的日记: 金币+20, ★★★★★最佳答案 2015-02-17 18:09:36
<Rij^2>是两点距离平方的平均值,<Rij>^2是两点距离平均的平方值,系综平均<>就是将所有任何两个原子之间遍历后求总和再除原子数,
编程思路是:
如果有N个原子,先做i=1:N的循环,,再j=1:N-1
计算i原子为中心与原子j 的距离Rij=,此时要注意一下周期性边界条件
把所有的Rij累加,把所有Rij平方累加,然后除以总原子数
2楼2015-02-16 15:09:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

维特的日记

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by abinitio at 2015-02-16 15:09:36
<Rij^2>是两点距离平方的平均值,<Rij>^2是两点距离平均的平方值,系综平均<>就是将所有任何两个原子之间遍历后求总和再除原子数,
编程思路是:
如果有N个原子,先做i=1:N的循环,,再j=1:N ...

谢谢你的回答!大体已经明白了,但是那个周期性边界要怎么处理呢,这个地方没怎么想明白
3楼2015-02-16 18:38:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 维特的日记 at 2015-02-16 18:38:50
谢谢你的回答!大体已经明白了,但是那个周期性边界要怎么处理呢,这个地方没怎么想明白...

如果在某一方向的位移值绝对值超过了晶格参数的一半,就将该方向的位移减或加上一个晶格参数,你想一下周期性边界条件的定义,就会理解了。
4楼2015-02-17 09:00:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 要骂人了,新模版改版就是要淡化问题凝练这种虚的东西,结果有个评委还在说凝练得不够 +3 瞬息宇宙 2026-08-31 6/300 2026-09-02 08:28 by 349506619
[基金申请] 科研人应该花精力去思考如何解决问题,而不是去凝练问题 +3 瞬息宇宙 2026-09-01 5/250 2026-09-02 08:01 by anjeeshine
[基金申请] 面上函评意见出来了,像什么等级? 20+4 Tsingking1 2026-08-27 17/850 2026-09-01 19:51 by 超级无敌华子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +5 bjdxyxy 2026-08-26 5/250 2026-09-01 17:54 by 小伟大博士
[基金申请] 学科评审组评审是指会评吗? +4 瞬息宇宙 2026-08-31 4/200 2026-09-01 14:58 by jiaoxg
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高,自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 能否申诉? +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中,共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 为什么到现在没收到通知? +5 tannykie 2026-08-29 5/250 2026-08-30 21:05 by purplejack
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 国自然评审意见 +13 wangmingqi 2026-08-28 19/950 2026-08-29 10:22 by Poppy1104
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[基金申请] 我不理解! +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
信息提示
请填处理意见