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playboy723

金虫 (正式写手)

[交流] 请教:载体怎样连接?

各位高手:请教一个问题,我这几天正在连接一个载体  片段有1500bp 双酶切  两端的酶切位点分别是BamH1和Xho1    我将片段和载体分别酶切、回收后进行连接  (应该切开了 因为同时做的另一个基因连上了) 连接的条件为:片段与载体比例为10:1   根据摩尔浓度算的   然后16度3小时以上  之后转化    结果没有插进去(虽然有阳性克隆  但挑了40多个克隆 都是假阳性和自连)  但同时做的另一个基因700多bp却挑出很多阳性克隆来   所以我想请教一下 :是否插入的片段越大连接越困难?  >1500bp的片段连接条件是怎样的?  或者还有其他的要求和问题我没有注意到  请各位高手不吝赐教  我都快烦死了  谢谢了
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yangym1123

木虫 (小有名气)

★ ★
lixiaoyi1981(金币+2,VIP+0):个人经验分享,谢谢
的确如此,片段越大,越是难以连接上,所以要连接上要保证插入片段的量足够多(浓度高),载体的量是要足够多,不知道你做连接的体系哦。我们做载体构建时,载体要100ng,插入片段也是较多,在调整一下吧!连接时间过夜试一下呢,我们都是16度,16小时,或者四度16小时!祝你好运哦!
2楼2008-06-11 19:38:56
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jiwu20

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
reasonspare(金币+3,VIP+0):谢谢分享,欢迎常来
载体要100ng,插入片段也是较多,在调整一下吧!连接时间过夜试一下呢,我们都是16度,6小时,或者四度16小时!



载体要这么多吗?越多自连率越高,楼主写错了吧
3楼2008-06-12 11:53:04
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jiwu20

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
reasonspare(金币+3,VIP+0):积极交流奖
引用回帖:
Originally posted by playboy723 at 2008-6-11 19:29:
各位高手:请教一个问题,我这几天正在连接一个载体  片段有1500bp 双酶切  两端的酶切位点分别是BamH1和Xho1    我将片段和载体分别酶切、回收后进行连接  (应该切开了 因为同时做的另一个基因连上了) 连接的条 ...

1、另一个基因两酶切位点是BamH1和Xho1?   吗。如果不是就不能说明问题。

2、如果是,建议用碱性磷酸酶处理一下载体,防止自连。试试吧。
4楼2008-06-12 11:58:38
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guoqin_shiyin

银虫 (正式写手)

★ ★ ★
reasonspare(金币+3,VIP+0):积极交流奖
1.5kb不算大片段的连接,我一般是4度过夜或者放两天才转化。
至于浓度的话只要你回收完后点样2微升或者1微升能够看见质粒就可以了,不需要100多NG那么多的。片段的浓度倒是需要加大。
5楼2008-06-12 14:16:11
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playboy723

金虫 (正式写手)

酶切是肯定没有问题的     酶切位点都确定没有问题  这点可以保证
另外我也觉得载体的量不能太大了  现在1:10的比例已经有很多自连的现象了  如果载体量加大的话那岂不是自连的更多了? 现在我也不敢肯定了    想要再加大片段的量可又怕连接效率更低     一般的是1:3-10时连接比例最高  再高的比例不知有高手做过没   有的话指教下小弟吧  做一次最少得4天  我折腾不起了  
下次准备切开后用CIP处理一下  看看情况如何
忘高手继续赐教
6楼2008-06-12 18:47:43
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yaoyaochong

银虫 (正式写手)

同命相连呀,我也是死活做不出来,我现在都开始怀疑一个3.6Kb 一个4.3 Kb的两个片段是不是能连起来,做了好几次了,都是出不来,不知道该怎么办了,明天再转一次,看看怎么样,不知道像两个这么大的片段,需要连接多长时间,过夜够了吧
7楼2008-06-12 20:13:19
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月月大可

木虫 (著名写手)

★
reasonspare(金币+1,VIP+0):积极交流奖
载体酶切后要回收,酶切一般不会彻底把载体切完全,不回收就有大量假阳性。
8楼2008-06-12 20:36:28
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jasco

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
reasonspare(金币+3,VIP+0):谢谢分享,欢迎常来
因为两个酶不是同尾酶,如果你的载体处理好了,那么自连的比例应该很低。楼主挑来鉴定的40个单克隆中不知道有多少是载体自连,建议重新酶切载体,回收后,最好做去磷酸化处理。

1.5kb的外源片段连接入载体,16度3小时足够,过夜会更好。
9楼2008-06-13 11:55:44
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playboy723

金虫 (正式写手)

谢谢大家的回复  我会试试的   大家如果还有其他建议的话敬请发言  我不胜感激     我的分子很弱的    做这个也是被逼无奈   请大家多指教  谢谢
10楼2008-06-13 21:26:31
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