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丫头小盆子

新虫 (小有名气)

[求助] Western 杂交不出条带,求助已有3人参与

各位前辈及虫友帮帮忙,最近做western杂交不出来目的条带,想求助各位指教。具体情况如下:
因为我做的是植物叶绿体蛋白,目的是想看叶绿体蛋白的变化情况,所以提取类囊体蛋白,用的是Hepes缓冲液。提取出的类囊体测定叶绿素含量后液氮速冻保存。跑western时,先跑了SDS胶用考马斯亮蓝定量,每孔上样量以叶绿素含量来订,大概是10ug每孔,最后以这个上样量来做western杂交。其中转膜为过夜,且maker也明显转到PVDF膜上了。再封闭2h,一抗5h,TBS清洗2次,每次20min,在用二抗杂交2h,最后再TBS清洗2次,每次10min。再显色,其中一抗是PBS缓冲液配制的,二抗是TBS缓冲液配制的,最后显色是采用碱性磷酸酶和NBT/BCIP一起来显色的。但是做过两次,第二次上样量增加到15ug每孔的叶绿素,但是也都还是没有目的条带。其中考马斯亮蓝定量时,能看出目的条带位置处是有条带的。请问各位前辈知道是什么原因么?会不会是因为一抗二抗缓冲液不同导致的呢?还是说是因为一抗特异性不高(但是一抗是刚买回来,按说明书稀释保存的,-20°C保存大概半年)?请各位前辈帮帮忙,不胜感激!
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董博士

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
丫头小盆子(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-08 20:28:44
为什么一抗二抗的缓冲液不一样,建议上样量增加到50,洗膜的时候不要太过剧烈。
医学&统计学
2楼2015-02-08 07:53:33
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丫头小盆子

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 董博士 at 2015-02-08 07:53:33
为什么一抗二抗的缓冲液不一样,建议上样量增加到50,洗膜的时候不要太过剧烈。

因为一抗买回来的时候,采用实验室常用的PBS缓冲液稀释。但是二抗因为更新了,更新的时候是小老板保存的,他采用的TBS缓冲液稀释的二抗。这个问题我提出来过,但是小老板的回答是没影响。所以我想向大家求证下是缓冲液的关系还是上样量的问题。
封闭、杂交及洗膜过程中摇床摇得剧烈不可行是有什么原因在里边吗?是怕结合在膜上的蛋白被清洗掉吗?
还有就是想问问碱性磷酸酶显色的方法对于western显色都是可行的么?有没有什么特别注意的?
3楼2015-02-08 12:41:38
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504775490

金虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
丫头小盆子(西门吹雪170代发): 金币+4, 鼓励回帖交流 2015-02-08 20:28:52
1.可以增加上样量
2.一抗可以4°冰箱过夜,如果抗体效价不高可以增大一抗浓度或者延长一抗孵育时间
3.洗一抗时,不要过于激烈,可以TBST洗5次,每次5min
4.二抗浓度适当,室温孵育1h即可(确定二抗没问题,可以做个平行实验,或者实验室其他人用一下,看是否工作)
5.洗二抗同洗一抗
6.我一般是选择ELC显影,没用过碱性磷酸酶显色法,所以没有有用的意见提供~~
封闭是用封闭液将PVDF膜没有结合蛋白的地方封闭上,减少背景,所以摇动要缓慢,提供充足的接触,也可以不要动,或者封闭过夜都可以。洗膜时摇动剧烈可能会将一抗洗掉,所以不要过于激烈。
祝实验顺利~~
4楼2015-02-08 13:57:26
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mulongyan

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我想提取类囊体,然后测定氮素的含量,能把提取类囊体的方法发给我一份吗?
谢谢!邮箱:mulongyan2008@163.com
5楼2015-05-05 22:13:38
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LIVESOCCER

金虫 (正式写手)

朋友,western做出来了么?是PSI和PSII的反应中心蛋白吧,我最近也要做,想用DAB显色法,灵敏度不如ELC压片子,但确实经济方便,加大上样量!还有一点想请教,文献上好多都是上样体积为10ug叶绿素,为啥根据叶绿素含量确定上样量呢?Hepes缓冲液提类囊体膜,2步去上清,叶绿素去掉大部分了吧!谢谢!
6楼2018-01-15 15:44:51
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LIVESOCCER

金虫 (正式写手)

朋友,杂出来了么!我也是分离类囊体膜,胶上有蛋白,用DAB显不出色,杂不出!最后怎么弄的,我想着用ECL做做看了,这个比底物显色灵敏,可能咱们的光合系统蛋白丰度是不是低。DAB显色做大丰度的rubisco显色没问题的。
7楼2018-01-21 22:23:20
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