24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2605  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lxx707

金虫 (小有名气)

[求助] 求助:扩线粒体基因组全序,中间有一段怎么都扩不出来,不知道还能采取什么方法? 已有5人参与

设计了不下20对引物了,有5对能扩出2000左右的片段,但一般测序不出来。拿去克隆,再测序。再不同公司做了比较,有一段2000bp两个公司做得一样,但是NCBI BLAST无结果。其他三段比对不想似,NCBI上也比不出任何东西。万能的亲们,请多多指教,多给注意,实在是太感谢了!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

徐官冲123

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 978835147 at 2015-11-17 19:58:49
找到原因了吗?我现在也是这个问题,每次都能扩出来,且很单一,很亮,大小也一致,但是每次测序结果都不是,不管是克隆,还是PCR,且每次的测序结果都不一样。很奇怪啊。

换酶重新扩,这个可能是假阳性,上下游并没有真正结合在一起
10楼2016-02-12 11:33:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

logowang

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lxx707(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-01-28 22:09:10
一般超过2000长度的,首选Phusion® High-Fidelity DNA Polymerase。 其扩增效率高,错误率极低,或许能够解决你的问题

关于测序,最好克隆到载体内去测序,测序结果来说,2000bp都什么没比对上很奇怪,你就是乱打的数据都能比对上好多,对于你的描述更多可能是克隆的片段出现问题,并不是你要的东西。

重新在进行克隆测序,会有一些新的提示
2楼2015-01-28 19:15:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zshw_001

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
lxx707(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-28 22:09:21
一般两千的序列总能看出是啥东西,能扩出来也说明确定有吧,除非PCR出错。
永远相信未知的总是美好的!
3楼2015-01-28 21:08:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
lxx707(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-01-28 22:09:30
我觉得应该是pcr的问题,引物一般克隆岛t载的话都没问题,除非片段不对,有参考线粒体基因组吗。或者在别的物质同源性高不高
一般线粒体都是保守的不会比对不出啥东西
4楼2015-01-28 21:18:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿2110,化学学硕310分,本科重点双非求调剂 +13 努力奋斗112 2026-04-08 13/650 2026-04-09 00:27 by Evan_Liu
[考研] 293调剂 +20 yj1221 2026-04-08 21/1050 2026-04-08 22:37 by 猪会飞
[考研] 368化学求调剂 +12 wwwwabcde 2026-04-07 13/650 2026-04-08 20:48 by LiuXingYu星星
[考研] 320分人工智能调剂 +9 振—TZ 2026-04-03 10/500 2026-04-08 19:56 by 振—TZ
[考研] 22408 318分求调剂 +4 勤奋的小笼包 2026-04-06 6/300 2026-04-07 15:05 by 纸鹤555
[考研] 316求调剂 +7 yyx想调剂 2026-04-05 7/350 2026-04-07 14:31 by shdgaomin
[考研] 080500求调剂 +12 黄宇博 2026-04-06 12/600 2026-04-07 12:41 by upczlm1989
[考研] 考研调剂 +7 15615482637 2026-04-04 7/350 2026-04-06 22:56 by chenzhimin
[考研] 324求调剂 +3 k可乐 2026-04-05 4/200 2026-04-06 09:54 by 蓝云思雨
[考研] 材料专硕283求调剂 +17 试试看呗 2026-04-04 18/900 2026-04-06 09:24 by 286640313
[考研] 283求调剂 +4 mcbbc 2026-04-03 5/250 2026-04-04 20:51 by imissbao
[考研] 368求调剂 +5 今华习 2026-04-03 7/350 2026-04-04 18:47 by imissbao
[考研] 一志愿北京科技大学材料工程085601,求调剂 +17 cdyw 2026-04-02 18/900 2026-04-04 11:14 by w_xuqing
[考研] 297求调剂 +11 ljy20040718! 2026-04-03 13/650 2026-04-04 09:23 by 来看流星雨10
[考研] 化工求调剂 +11 荔香芝士椰奶 2026-04-03 11/550 2026-04-03 22:06 by 啵啵啵0119
[考研] 数二英二348求调剂 +4 hxdzj1 2026-04-03 5/250 2026-04-03 21:25 by zhq0425
[考研] 303求调剂 +3 一色清羽 2026-04-02 4/200 2026-04-03 10:22 by 蓝云思雨
[考研] 材料340分调剂 +7 夏夜晚风_long 2026-04-02 9/450 2026-04-02 21:20 by dongzh2009
[考研] 346求调剂 +5 郑诚乐 2026-04-02 5/250 2026-04-02 16:38 by SZW_UJN
[考研] 348求调剂 +6 吴彦祖24k 2026-04-02 6/300 2026-04-02 14:07 by 给你你注意休息
信息提示
请填处理意见