应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » Forcite吸附结构优化
51/1返回列表
查看: 2562  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

xb490284223

金虫 (正式写手)

蘑菇头

[求助] Forcite吸附结构优化 已有1人参与

假设吸附质为A，吸附剂为B，则用Dmol或者CASTEP模块对吸附质A，对吸附剂B，和(A+B)整个结构优化，分别得到的能量为EA，EB和E(A+B)。则吸附能E=EA+EB-E(A+B)。用这两个模块通过这个公式可以得到吸附能。
但是我现在对于同样的问题，用的是Forcite模块中的Geometry Optimization，同样能得到上面的三个参数，请问还是用E=EA+EB-E(A+B)这个公式，得到的是吸附能吗？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

计算化学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-12-22 19:42:37
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xb490284223: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-12-23 12:55:26
Dmol或者CASTEP属于量子化学模块，在分子优化的时候考虑了原子核外电子，优化得到的构型和能量比较准确，但是需要设计多个原始构型，因为它只能找到局部最优。
Forcite属于分子动力学模块，把原子看成质点，能找到全局最优，但是光优化不够，最好做做动力学，通过统计得到的吸附能才有说服力。
若楼主分子不大，结构式简单，建议用量化模块，但是要充分考虑所有可能的构型
赞一下 回复此楼
2楼2014-12-23 08:29:01
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xb490284223

金虫 (正式写手)

蘑菇头
引用回帖:
2楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-12-23 08:29:01
Dmol或者CASTEP属于量子化学模块，在分子优化的时候考虑了原子核外电子，优化得到的构型和能量比较准确，但是需要设计多个原始构型，因为它只能找到局部最优。
Forcite属于分子动力学模块，把原子看成质点，能找到 ...

非常感谢你的回答。我还有一些问题：
1.我是计算的聚合物纤维素吸附气体分子，可以考虑用纤维素单体。我以前考虑过用DMol，但是纤维素结构中有苯环，和金属原子吸附气体不太一样，感觉无法用简单的定位，桥位来判断的原始构型。也没找到相关文献，希望你给予帮助。
2.我用Forcite进行了结构优化后，用dynamic进行动力学计算，如何查看其吸附能，这个我没找到，求解释。
赞一下 回复此楼
3楼2014-12-23 09:49:45
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
xb490284223: 金币+5, ★有帮助 2014-12-23 12:56:52
引用回帖:
3楼: Originally posted by xb490284223 at 2014-12-23 09:49:45
非常感谢你的回答。我还有一些问题：
1.我是计算的聚合物纤维素吸附气体分子，可以考虑用纤维素单体。我以前考虑过用DMol，但是纤维素结构中有苯环，和金属原子吸附气体不太一样，感觉无法用简单的定位，桥位来判 ...

1. 你可以考虑下sorption这个模块
2. 吸附能不是直接查看的，用你列出的那个公式去计算
赞一下 回复此楼
4楼2014-12-23 11:18:07
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xb490284223

金虫 (正式写手)

蘑菇头
引用回帖:
4楼: Originally posted by 赵红霞 at 2014-12-23 11:18:07
1. 你可以考虑下sorption这个模块
2. 吸附能不是直接查看的，用你列出的那个公式去计算...

好的。暂时明白了。再请教个问题：
我根据文献提供的原子坐标和空间群画好了分子结构晶胞。然后将其中的分子结构复制出来，重新用AC放入盒子中，这时盒子的晶格参数和之前的晶格参数不一样。此时我对整个结构进行优化，请问还需要进行晶胞优化吗？
赞一下 回复此楼
5楼2014-12-23 12:56:46
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xb490284223 的主题更新
51/1返回列表
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 307求调剂 +3 wyyyqx 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:20 by JourneyLucky
[考研] 材料工程（专）一志愿985 初试335求调剂 +3 hiloiy 2026-03-17 4/200 2026-03-21 03:04 by JourneyLucky
[考研] 299求调剂 +6 △小透明* 2026-03-17 6/300 2026-03-21 02:42 by JourneyLucky
[考研] 一志愿华中科技大学，080502，354分求调剂 +5 守候夕阳CF 2026-03-18 5/250 2026-03-21 01:06 by JourneyLucky
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境专硕，总分308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-18 3/150 2026-03-21 00:39 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:32 by JourneyLucky
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 287求调剂 +7 晨昏线与星海 2026-03-19 8/400 2026-03-20 22:19 by JourneyLucky
[考研] 085600材料与化工 +8 安全上岸！ 2026-03-16 8/400 2026-03-20 22:13 by luoyongfeng
[考研] 329求调剂 +9 想上学吖吖 2026-03-19 9/450 2026-03-20 22:01 by luoyongfeng
[考研] 求调剂一志愿南京航空航天大学289分 +3 @taotao 2026-03-19 3/150 2026-03-20 21:34 by JourneyLucky
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
[考研] 289求调剂 +6 怀瑾握瑜l 2026-03-20 6/300 2026-03-20 20:30 by 学员8dgXkO
[考研] 319求调剂 +3 小力气珂珂 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:47 by JourneyLucky
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 一志愿福大288有机化学，求调剂 +3 小木虫200408204 2026-03-18 3/150 2026-03-19 13:31 by houyaoxu
[考研] 268求调剂 +8 一定有学上- 2026-03-14 9/450 2026-03-17 17:47 by laoshidan
[考研] 机械专硕325，寻找调剂院校 +3 y9999 2026-03-15 5/250 2026-03-16 19:58 by y9999
[考研] 中科院材料273求调剂 +4 yzydy 2026-03-15 4/200 2026-03-16 15:59 by Gaodh_82
[考研] 中科大材料与化工319求调剂 +3 孟鑫材料 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:10 by ms629
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭