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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS怎么随机取代超晶胞中分子
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wangjielin

新虫 (小有名气)

[求助] MS怎么随机取代超晶胞中分子 已有1人参与

画了一个包含16个分子的超晶胞（如图），现在想用另一个分子随机取代超晶胞中8个分子。逛了很久，只找到替换超晶胞中原子的方法，请大神解答！！谢谢！！！

MS怎么随机取代超晶胞中分子
超晶胞.jpg
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1楼 2014-12-19 18:15:18
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wangjielin

新虫 (小有名气)
自顶，谢谢！！！
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2楼2014-12-19 18:17:25
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但丁

木虫 (小有名气)
可以用Perl写个脚本实现，但是Perl语言编程基础太差，我的做法是输出cif格式文件，然后把cif文件中的元素名称随机替换（linux shell脚本写的），也可以实现，但是转来转去比较麻烦。不知哪位大神可提供下现成的脚本啊。
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3楼2014-12-19 19:44:23
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gaupay

至尊木虫 (正式写手)
竟然是研究CL20的

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Godblessgoodman
4楼2014-12-20 00:42:47
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gaupay

至尊木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by 但丁 at 2014-12-19 19:44:23
可以用Perl写个脚本实现，但是Perl语言编程基础太差，我的做法是输出cif格式文件，然后把cif文件中的元素名称随机替换（linux shell脚本写的），也可以实现，但是转来转去比较麻烦。不知哪位大神可提供下现成的脚本 ...

我可以写perl，感觉perl使用还是很简单的，可以用好shell的，学习perl还是不难的。我shell用不好-_-||

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Godblessgoodman
5楼2014-12-20 00:46:14
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wangjielin

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by gaupay at 2014-12-20 00:42:47
竟然是研究CL20的

高手！！！
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6楼2014-12-20 09:47:00
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wangjielin

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by gaupay at 2014-12-20 00:46:14
我可以写perl，感觉perl使用还是很简单的，可以用好shell的，学习perl还是不难的。我shell用不好-_-||
...

3楼和5楼都太专业了，我这个新手直接听懵了。。。还是感谢，不知道有没有简单点的、可以直接操作的方法？？
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7楼2014-12-20 09:49:03
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但丁

木虫 (小有名气)
你要想随机替换的话只能自己编程了，好像没有你所说的简单的、直接操作的方法。
做起来其实也不难，就是一个查找替换的过程，去找本Perl或者shell脚本的书啃个两天就差不多了。
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8楼2014-12-20 16:39:31
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wangjielin

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 但丁 at 2014-12-20 16:39:31
你要想随机替换的话只能自己编程了，好像没有你所说的简单的、直接操作的方法。
做起来其实也不难，就是一个查找替换的过程，去找本Perl或者shell脚本的书啃个两天就差不多了。

谢谢大神，那只能找本书看看了。。另，对晶胞进行切割后，对所切割的晶面上的所有分子进行替换有没有简单的方法？也得按你说的这种方法做吗？
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9楼2014-12-20 17:52:40
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yeahhanpei

金虫 (正式写手)
楼主现在知道怎么去取代分子了吗，我最近用到了这个，但不知道怎么做，你知道的话麻烦告知下，么么
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我的梦想那么大，我却离得那么远！
10楼2017-03-02 11:27:01
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