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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

[求助] ts confirmation如何使用

刚接触过渡态搜索,想知道一下,ts search后,如何确定虚频。是不是对ts search后生成的过渡态文件xsd,进行IR计算,再用震动分析。还是在TS search的时候就在属性里面勾选IR计算。还有计算声子可以实现不?在castep里面没有发现过渡态精修,即使发现虚频不止一个,要怎么应对呢?还有就是ts confirmation怎么使用,是对TS search计算生成的xtd文件进行计算吗?
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流! 2014-12-21 21:43:27
说白了就是只能根据结构的不合理的地方慢慢手工调整,我印象中MS图形界面下没办法对castep的振动模进行显示,所以是相当麻烦的事情。建议可以到castep的官方社区问问,也许有人能简单解决。

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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
6楼2014-12-20 14:05:10
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

求高人指点!!!!!!!!!!!1
2楼2014-12-19 08:57:09
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

咱们这个区做过渡态的应该不少吧,求知道的能细心指点一下!!!!!!!!
3楼2014-12-19 14:58:19
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流! 2014-12-19 18:42:39
TS confirmation是在TS search的xtd上做,计算频率直接计算声子谱即可,一般超软赝势只能采用有限差分。如果有虚频要沿着虚频振动方向进行手工微调(印象是将虚频处键长*1.3,记得不清楚,可去量化版看看手工消虚频的方法),到目前手头上的7.0没法进行过渡态精修,下一个版本暂时不明。
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4楼2014-12-19 17:49:28
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-12-19 17:49:28
TS confirmation是在TS search的xtd上做,计算频率直接计算声子谱即可,一般超软赝势只能采用有限差分。如果有虚频要沿着虚频振动方向进行手工微调(印象是将虚频处键长*1.3,记得不清楚,可去量化版看看手工消虚频 ...

对您的解释不是很明白,能否再详细说一下,如果出现多个虚频,对于castep该如何处理。非常感谢!
5楼2014-12-19 22:38:29
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-12-20 14:05:10
说白了就是只能根据结构的不合理的地方慢慢手工调整,我印象中MS图形界面下没办法对castep的振动模进行显示,所以是相当麻烦的事情。建议可以到castep的官方社区问问,也许有人能简单解决。
...

感谢您的细心回复。
7楼2014-12-20 21:26:27
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
7楼: Originally posted by xxxxxxxfc at 2014-12-20 21:26:27
感谢您的细心回复。...

做反应还是DMol3方便点,而且精度并不比CASTEP差。
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8楼2014-12-20 21:52:14
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-12-20 21:52:14
做反应还是DMol3方便点,而且精度并不比CASTEP差。...

我是做扩散的,dmol3计算出来的势垒值与实验值相差很大,castep比较接近。
9楼2014-12-21 10:47:41
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

有可能参数不合理所致,如果不是很大的话可以把IS和FS传上来,我跑个DMol3 测试看看.也不妨把castep的结果发来看看做个对比。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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10楼2014-12-21 14:49:55
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