应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » ts confirmation如何使用
221/3返回列表123下一页
查看: 4622  |  回复: 21
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

[求助] ts confirmation如何使用

刚接触过渡态搜索，想知道一下，ts search后，如何确定虚频。是不是对ts search后生成的过渡态文件xsd，进行IR计算，再用震动分析。还是在TS search的时候就在属性里面勾选IR计算。还有计算声子可以实现不？在castep里面没有发现过渡态精修，即使发现虚频不止一个，要怎么应对呢？还有就是ts confirmation怎么使用，是对TS search计算生成的xtd文件进行计算吗？
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-12-18 23:15:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流！ 2014-12-21 21:43:27
说白了就是只能根据结构的不合理的地方慢慢手工调整，我印象中MS图形界面下没办法对castep的振动模进行显示，所以是相当麻烦的事情。建议可以到castep的官方社区问问，也许有人能简单解决。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

xxxxxxxfc
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
6楼2014-12-20 14:05:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
求高人指点！！！！！！！！！！！1
回复此楼
2楼2014-12-19 08:57:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
咱们这个区做过渡态的应该不少吧，求知道的能细心指点一下！！！！！！！！
赞一下 回复此楼
3楼2014-12-19 14:58:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流！ 2014-12-19 18:42:39
TS confirmation是在TS search的xtd上做，计算频率直接计算声子谱即可，一般超软赝势只能采用有限差分。如果有虚频要沿着虚频振动方向进行手工微调（印象是将虚频处键长*1.3，记得不清楚，可去量化版看看手工消虚频的方法），到目前手头上的7.0没法进行过渡态精修，下一个版本暂时不明。
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-12-19 17:49:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-12-19 17:49:28
TS confirmation是在TS search的xtd上做，计算频率直接计算声子谱即可，一般超软赝势只能采用有限差分。如果有虚频要沿着虚频振动方向进行手工微调（印象是将虚频处键长*1.3，记得不清楚，可去量化版看看手工消虚频 ...

对您的解释不是很明白，能否再详细说一下，如果出现多个虚频，对于castep该如何处理。非常感谢！
赞一下 回复此楼
5楼2014-12-19 22:38:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-12-20 14:05:10
说白了就是只能根据结构的不合理的地方慢慢手工调整，我印象中MS图形界面下没办法对castep的振动模进行显示，所以是相当麻烦的事情。建议可以到castep的官方社区问问，也许有人能简单解决。
...

感谢您的细心回复。
赞一下 回复此楼
7楼2014-12-20 21:26:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
7楼: Originally posted by xxxxxxxfc at 2014-12-20 21:26:27
感谢您的细心回复。...

做反应还是DMol3方便点，而且精度并不比CASTEP差。
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
8楼2014-12-20 21:52:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-12-20 21:52:14
做反应还是DMol3方便点，而且精度并不比CASTEP差。...

我是做扩散的，dmol3计算出来的势垒值与实验值相差很大，castep比较接近。
赞一下 回复此楼
9楼2014-12-21 10:47:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
有可能参数不合理所致，如果不是很大的话可以把IS和FS传上来，我跑个DMol3 测试看看.也不妨把castep的结果发来看看做个对比。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
10楼2014-12-21 14:49:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xxxxxxxfc 的主题更新
221/3返回列表123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 291求调剂 +7 关忆北. 2026-04-14 7/350 2026-04-15 14:39 by 黑科技花岗岩
[考研] 药学305求调剂 +7 玛卡巴卡boom 2026-04-11 7/350 2026-04-15 13:21 by 西北望—风沙
[考研] 材料专业344求调剂 +17 hualkop 2026-04-10 22/1100 2026-04-14 16:21 by sxdj2
[考研] 本科211，报考085601-310分 +16 ararak 2026-04-13 16/800 2026-04-14 14:55 by Delta2012
[考研] 297求调剂 +23 ORCHID1 2026-04-10 26/1300 2026-04-14 13:52 by 陈皮皮
[考研] 085600材料与化工349分求调剂 +16 李木子啊哈哈 2026-04-12 17/850 2026-04-14 09:11 by fenglj492
[考研] 考研求调剂 +12 子木呐 2026-04-12 13/650 2026-04-14 01:19 by 王珺璞
[考研] 297工科，求调剂? +13 河南农业大学-能 2026-04-12 13/650 2026-04-13 14:12 by dingyanbo1
[考研] 本科南方医科大学 一志愿985 药学学硕284分 求调剂 +5 弱水听文 2026-04-09 5/250 2026-04-12 13:16 by shengxi123
[考研] 一志愿郑州大学 22408 305分求调剂 +5 安小满zzz 2026-04-08 5/250 2026-04-12 00:41 by 蓝云思雨
[考研] 农学0904 312求调剂 +6 Say Never 2026-04-10 6/300 2026-04-11 10:33 by wwj2530616
[考研] 283求调剂，工科！ +12 苏打水7777 2026-04-08 12/600 2026-04-11 10:28 by 逆水乘风
[考研] 一志愿985机械学硕380求调剂 +5 关关雎鸠10 2026-04-11 5/250 2026-04-11 10:10 by 知念。A
[考研] 22408调剂求助 +7 毂12 2026-04-09 9/450 2026-04-11 09:23 by 哦哦123
[考研] 一志愿东北大学控制工程085406数二英二385，求调剂 +8 Ezra_Zhang 2026-04-09 8/400 2026-04-11 09:15 by 猪会飞
[考研] 298求调剂 +13 钉叮咚冬瓜 2026-04-09 13/650 2026-04-10 15:49 by jiajinhpu
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +9 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-09 10/500 2026-04-09 20:01 by Orcid
[考研] 0703化学求调剂 +21 不知名的小卅 2026-04-08 21/1050 2026-04-09 18:55 by l_paradox
[考研] 083200 初试305分 求调剂 暂不考虑跨专业 +15 Claireyyyy 2026-04-09 15/750 2026-04-09 16:11 by zhuimr
[考研] 349学科化学045106求调剂，化学类都可以 +8 保好懂懂 2026-04-08 8/400 2026-04-09 14:03 by xulei3024
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭