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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)

[求助] ts confirmation如何使用

刚接触过渡态搜索，想知道一下，ts search后，如何确定虚频。是不是对ts search后生成的过渡态文件xsd，进行IR计算，再用震动分析。还是在TS search的时候就在属性里面勾选IR计算。还有计算声子可以实现不？在castep里面没有发现过渡态精修，即使发现虚频不止一个，要怎么应对呢？还有就是ts confirmation怎么使用，是对TS search计算生成的xtd文件进行计算吗？
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1楼 2014-12-18 23:15:06
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流！ 2014-12-21 21:43:27
说白了就是只能根据结构的不合理的地方慢慢手工调整，我印象中MS图形界面下没办法对castep的振动模进行显示，所以是相当麻烦的事情。建议可以到castep的官方社区问问，也许有人能简单解决。

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xxxxxxxfc
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
6楼2014-12-20 14:05:10
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普通回帖

xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
求高人指点！！！！！！！！！！！1
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2楼2014-12-19 08:57:09
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
咱们这个区做过渡态的应该不少吧，求知道的能细心指点一下！！！！！！！！
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3楼2014-12-19 14:58:19
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★
ljw4010: 金币+2, 谢谢交流！ 2014-12-19 18:42:39
TS confirmation是在TS search的xtd上做，计算频率直接计算声子谱即可，一般超软赝势只能采用有限差分。如果有虚频要沿着虚频振动方向进行手工微调（印象是将虚频处键长*1.3，记得不清楚，可去量化版看看手工消虚频的方法），到目前手头上的7.0没法进行过渡态精修，下一个版本暂时不明。
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4楼2014-12-19 17:49:28
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-12-19 17:49:28
TS confirmation是在TS search的xtd上做，计算频率直接计算声子谱即可，一般超软赝势只能采用有限差分。如果有虚频要沿着虚频振动方向进行手工微调（印象是将虚频处键长*1.3，记得不清楚，可去量化版看看手工消虚频 ...

对您的解释不是很明白，能否再详细说一下，如果出现多个虚频，对于castep该如何处理。非常感谢！
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5楼2014-12-19 22:38:29
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-12-20 14:05:10
说白了就是只能根据结构的不合理的地方慢慢手工调整，我印象中MS图形界面下没办法对castep的振动模进行显示，所以是相当麻烦的事情。建议可以到castep的官方社区问问，也许有人能简单解决。
...

感谢您的细心回复。
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7楼2014-12-20 21:26:27
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
7楼: Originally posted by xxxxxxxfc at 2014-12-20 21:26:27
感谢您的细心回复。...

做反应还是DMol3方便点，而且精度并不比CASTEP差。
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8楼2014-12-20 21:52:14
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xxxxxxxfc

金虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-12-20 21:52:14
做反应还是DMol3方便点，而且精度并不比CASTEP差。...

我是做扩散的，dmol3计算出来的势垒值与实验值相差很大，castep比较接近。
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9楼2014-12-21 10:47:41
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
有可能参数不合理所致，如果不是很大的话可以把IS和FS传上来，我跑个DMol3 测试看看.也不妨把castep的结果发来看看做个对比。

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10楼2014-12-21 14:49:55
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