应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 如何把mRNA上的启动子对应到染色体上？
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
41/1返回列表
查看: 1430  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

pappi

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何把mRNA上的启动子对应到染色体上？ 已有1人参与

我刚刚研一，以前没有接触过生物信息学方面的工具。我老师让我把mRNA上找到的启动子在对应染色体上的位置找到。
请问是有什么软件可以做？还是直接就用NCBI上查找就可以了？我也是刚刚用NCBI没多久，用的不熟。
还请大家指点一下，谢谢。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-12-04 16:53:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
pappi(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-12-04 19:52:31
pappi: 金币+3, ★★★很有帮助 2014-12-11 19:34:18
不同基因启动子区域不完全相同，一般认为一个基因的启动子序列位于起始密码子上游约2000bp范围内，而基因mRNA序列起始密码子前面5‘UTR一般也就几十到几百bp，如果你序列不多，可以直接用你的mRNA序列对该物种的基因组序列做blast比对，找到你mRNA起始密码子对应的基因组位置，往前移动2000bp就得到你基因启动子所在区域，如果你mRNA序列很多，可以编程完成这些工作。
赞一下 回复此楼
2楼2014-12-04 18:21:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pappi

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-12-04 18:21:34
不同基因启动子区域不完全相同，一般认为一个基因的启动子序列位于起始密码子上游约2000bp范围内，而基因mRNA序列起始密码子前面5‘UTR一般也就几十到几百bp，如果你序列不多，可以直接用你的mRNA序列对该物种的基因 ...

谢谢你的指点。我有一点问错了，我导师是让我把起始密码子对应到染色体上。我用的是clustalX把cDNA和DNA作比对，第一个出现的ATG就是起始密码子，然后我把DNA的位置告诉了导师，导师说不对，是要染色体的位置，我是不是再把DNA所在染色体的位置告诉他就行了？
赞一下 回复此楼
3楼2014-12-05 16:12:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by pappi at 2014-12-05 16:12:14
谢谢你的指点。我有一点问错了，我导师是让我把起始密码子对应到染色体上。我用的是clustalX把cDNA和DNA作比对，第一个出现的ATG就是起始密码子，然后我把DNA的位置告诉了导师，导师说不对，是要染色体的位置，我是 ...

对，比对的时候推荐用blast，用你的mRNA序列与基因组数据（里面有染色体位置信息）比对。
赞一下 回复此楼
4楼2014-12-05 16:35:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 pappi 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿同济大学323分（080500）求调剂 +5 yikeniu 2026-04-01 5/250 2026-04-02 11:17 by xiaoranmu
[考研] 材料专硕322分 +4 哈哈哈吼吼吼哈 2026-04-02 4/200 2026-04-02 10:26 by Wang200018
[考研] 生物学308分求调剂（一志愿华东师大） +5 相信必会光芒万� 2026-03-31 6/300 2026-04-02 10:16 by guoweigw
[考研] 求调剂，一志愿 南京航空航天大学 ，080500材料科学与工程学硕，总分289分 +11 @taotao 2026-03-29 11/550 2026-04-02 10:04 by realme321
[考研] 【求调剂】新能源材料本科，一志愿211，初试321 +6 求调剂学校， 2026-04-02 6/300 2026-04-02 09:41 by 晴空210210
[考研] 367求调剂 +8 芋泥啵啵… 2026-03-28 8/400 2026-04-02 09:20 by olim
[考研] 材料调剂 +12 一样YWY 2026-04-01 12/600 2026-04-02 09:15 by olim
[考研] 266求调剂 +10 阳阳哇塞 2026-04-01 10/500 2026-04-02 09:07 by vgtyfty
[考研] 土木304求调剂 +6 兔突突突， 2026-03-31 7/350 2026-04-02 09:06 by coolminer
[考研] 310分求调剂 +4 成功上岸wang 2026-04-01 4/200 2026-04-01 20:35 by liu823948201
[考研] 290求调剂 +5 dfffsar 2026-03-29 5/250 2026-04-01 19:45 by 6781022
[考研] 英一数二生物信息学287分，本科生物科学，求调剂 +3 碧水xyz 2026-03-29 4/200 2026-04-01 15:35 by plum
[考研] 085410人工智能 初试316分 求调剂 +3 残星拂曙 2026-03-31 3/150 2026-04-01 11:09 by 小熊raider
[考研] 土木304求调剂 +5 顶级擦擦 2026-03-31 5/250 2026-04-01 08:15 by fdcxdystjk￥
[考研] 329求调剂，一志愿西北工业大学，材料工程（085601） +6 小小机灵虫 2026-03-29 12/600 2026-03-31 16:58 by 记事本2026
[考研] 材料工程专硕求调剂 +10 hyl3153942 2026-03-29 10/500 2026-03-31 16:31 by hypershenger
[考研] 277跪求调剂 +8 1915668 2026-03-27 13/650 2026-03-31 14:58 by 王亮_大连医科大
[考研] 276求调剂 +3 赵久华 2026-03-29 3/150 2026-03-31 10:06 by cal0306
[考研] 085602化工求调剂（331分） +8 111@127 2026-03-30 8/400 2026-03-30 21:23 by 研究僧导导
[考研] 265求调剂11408 +3 刘小鹿lu 2026-03-27 3/150 2026-03-27 20:53 by nihaoar
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭