24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 745  |  回复: 3

HSE06

新虫 (小有名气)

[求助] 求助GROMACS中周期性边界条件可以只取一個方向吗? 已有3人参与

麻烦请教各位,
GROMACS中周期性边界条件可以只取一個方向吗?

我测试了只取Z轴方向周期性,但是发现提示错误,
Invalid enum 'z' for variable pbc, using 'xyz'
  Next time use one of: 'xyz' 'no' 'xy' 'screw'。
手册上也是提示可以选则xy, no 和xyz。

所以比较困惑,是不是 GROMACS 不可以选择Z方向周期性呢?
非常感谢大家的帮助。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

abinitio

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
没用过这个软件,不过从模型上来理解,应该没法设置一个方向的周期边界条件吧。二维的是膜,一维是什么?

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-12-01 21:35:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

声梦奇缘001

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
gromacs只支持在xyz和xy方向的周期性,不支持单独方向上的周期性

[ 发自小木虫客户端 ]
只做不说,明知没地位,坚信有机会
3楼2014-12-02 23:03:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lisuperyao

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
现在不支持单方向的 5.0以后新版本我还没接触过 或许支持了?
4楼2014-12-03 08:48:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 HSE06 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿0817化学工程与技术,求调剂 +7 我不是只因 2026-04-02 8/400 2026-04-03 00:15 by 雨天撑伞
[考研] 280求调剂 +13 咕噜晓晓 2026-04-02 14/700 2026-04-02 22:53 by 无际的草原
[考研] 316求调剂 +12 舟自梗 2026-04-01 16/800 2026-04-02 17:33 by zzsw+
[考研] 085600,材料与化工321分求调剂 +11 大馋小子 2026-03-28 11/550 2026-04-02 15:59 by yunlongyang
[考研] 材料求调剂 一志愿哈工大总分298分,前三科223分 +12 dongfang59 2026-03-27 12/600 2026-04-02 12:26 by ms629
[考研] 085601 材料工程 313分 求调剂 +7 Ong3 2026-03-27 7/350 2026-04-02 11:29 by 3041
[考研] 261求B区调剂 +5 明仔· 2026-04-01 7/350 2026-04-02 11:17 by 邹尉尉
[考研] 求调剂,一志愿 南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕,总分289分 +11 @taotao 2026-03-29 11/550 2026-04-02 10:04 by realme321
[考研] 372求调剂 +3 jj涌77 2026-04-02 3/150 2026-04-02 09:57 by olim
[考研] 0710生物学,325求调剂 +3 mkkkkkl 2026-04-01 3/150 2026-04-02 09:48 by Jaylen.
[考研] 303求调剂 +8 DLkz1314. 2026-03-30 8/400 2026-04-02 09:08 by sanrepian
[考研] 266分,一志愿电气工程,本科材料,求材料专业调剂 +10 哇呼哼呼哼 2026-04-01 11/550 2026-04-01 21:48 by chyhaha
[考研] 310分求调剂 +4 成功上岸wang 2026-04-01 4/200 2026-04-01 20:35 by liu823948201
[考研] 求调剂0703 +5 周嘉尧 2026-03-31 8/400 2026-04-01 20:32 by ltltkkk
[考研] 一志愿 南京航空航天大学 ,080500材料科学与工程学硕 +7 @taotao 2026-03-30 7/350 2026-04-01 14:30 by chenqifeng666
[考研] 求调剂 +4 DADA怪 2026-03-31 4/200 2026-04-01 14:30 by ZXlzxl0425
[考研] 生物学296求调剂 +10 汤圆包 2026-03-29 14/700 2026-04-01 10:44 by 求调剂zz
[考研] 土木304求调剂 +3 兔突突突, 2026-03-31 3/150 2026-04-01 09:42 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +3 末未mm 2026-03-30 5/250 2026-03-30 17:23 by 王保杰33
[考研] 295求调剂 +5 1428151015 2026-03-27 6/300 2026-03-28 04:04 by fmesaito
信息提示
请填处理意见