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贝努努哈哈

铜虫 (小有名气)

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[求助] 引物设计已有3人参与

大家看一下我设计的引物合适不

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1楼 2014-11-26 15:51:58

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贝努努哈哈

铜虫 (小有名气)

引用回帖:

2楼: Originally posted by soarrow at 2014-11-29 01:09:54
看了一下第一对引物，二聚体的概率不小--即使去除了酶切位点。把酶切位点加上之后，二聚体更多了。
上下游引物进行blast以后，与假丝酵母Candida utilis匹配度挺好，但是也与毕赤酵母Pichia jadinii strain CCTCC ...

10楼2014-12-08 16:21:10

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soarrow

铁杆木虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-11-29 15:15:09

看了一下第一对引物，二聚体的概率不小--即使去除了酶切位点。把酶切位点加上之后，二聚体更多了。
上下游引物进行blast以后，与假丝酵母Candida utilis匹配度挺好，但是也与毕赤酵母Pichia jadinii strain CCTCC AY204007 uricase gene存在很高匹配。特异性有所影响，不过影响应该不大。
总体来说，应该能用。

一个小经验，设计引物时候可以多设计合成两套，到时候几套一起测试，哪套好用用哪套---毕竟现在引物和PCR反应液都很便宜了。