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YILUK

金虫 (小有名气)

[求助] Gromacs跑复合物,能量最小化前用grompp处理输入文件时出现这种情况怎么办

如题:
命令是 grompp -f em.mdp -c trp_b4em.pdb -p trp.top -o em.tpr
结果出错了:
Program grompp, VERSION 4.5
Source code file: toppush.c, line: 1228

Fatal error:
moleculetype CU1 is redefined
For more information and tips for troubleshooting, please check the GROMACS
website at http://www.gromacs.org/Documentation/Errors
查找了所有文件就是找不到CU1
求大神帮帮忙
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YILUK

金虫 (小有名气)

问题解决了。。。原因是在top文件里定义了两次ions.itp。。。
删掉一个就好啦
2楼2014-11-26 15:11:50
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