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反对法国的话

新虫 (初入文坛)

[交流] 怎样鉴定和确认药物与细胞内相互作用的蛋白质? 已有4人参与

怎样鉴定和确认某种药物与细胞内相互作用的蛋白质是什么?要用到什么方法,我也是才转到这个学科,不是很清楚,求指导!
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反对法国的话

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 董博士 at 2014-11-21 09:22:53
这个属于大规模筛选实验了吧,因为药物处理后,肯定会引起多种蛋白的变化的,毕竟属于体外的一种刺激了,我知道的方法就是:分两组,药物处理和不处理的两组细胞,分别提取细胞总RNA,去做RNA-seq,将数据进行比对, ...

谢谢你,我明白了一点,我听老师说我们好像要用质谱,用这个是做什么实验,你知道吗?
3楼2014-11-21 11:18:55
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董博士

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-11-21 23:20:56
这个属于大规模筛选实验了吧,因为药物处理后,肯定会引起多种蛋白的变化的,毕竟属于体外的一种刺激了,我知道的方法就是:分两组,药物处理和不处理的两组细胞,分别提取细胞总RNA,去做RNA-seq,将数据进行比对,找到差异基因,这些基因编码的蛋白都有可能受到该药物的作用,然后再进行后续实验的验证,比如基因A上调了,那您可以在细胞中加或不加该药物处理,wastern检测基因A所编码的蛋白表达是否增加。这是我的建议,希望对您有帮助,祝实验顺利哈~
医学&统计学
2楼2014-11-21 09:22:53
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fuyuandj86

版主 (著名写手)

己所不欲,勿施于人


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
把药物分子偶联在树脂上,和细胞裂解液孵育,然后洗几遍,最后看看有哪些蛋白留在了树脂上
蛋白含量可能很低,必须要用质谱做鉴定
The doer of good becomes good, the doer of evil becomes evil.
4楼2014-11-22 01:21:14
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yangyufeng88

木虫 (正式写手)

CoIP

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
要适应生活,才能改变生活!
5楼2014-11-23 14:06:04
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