应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 结构优化后的笛卡尔坐标在哪里找呢？
71/1返回列表
查看: 2638  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lltyy

金虫 (小有名气)

[求助] 结构优化后的笛卡尔坐标在哪里找呢？ 已有3人参与

审稿人意见，Cartesian coordinates of all the optimized geometries should be provided in the supporting information.
是不是要增加优化结构的笛卡尔坐标呢？不是搞计算的，不太懂，能不能请各位大神指教如何在计算结果里找到这一数据，万分感谢！
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

经验

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-11-17 01:11:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+2 2014-11-17 07:53:17
lltyy: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢 2014-11-17 17:56:36
一般在优化计算的输出文件末尾，最后一组结构坐标即是
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2014-11-17 06:59:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZJboy

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
其实用GV打开输出文件，再保存成输入文件，就会在输入文件中产生笛卡尔坐标。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2014-11-18 09:53:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lltyy

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by ZJboy at 2014-11-18 02:53:27
其实用GV打开输出文件，再保存成输入文件，就会在输入文件中产生笛卡尔坐标。

第一个原子的坐标是0 0 0吗？
赞一下 回复此楼
4楼2014-11-18 17:43:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

羊羊甜点屋0

铜虫 (正式写手)
是模拟的结果吧？在molden.dat的文件里。
赞一下 回复此楼
5楼2014-11-19 20:53:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

绍敏郡主

木虫 (著名写手)
你的计算结果都写成论文了，还不知道怎么找分子坐标
赞一下 回复此楼
6楼2014-11-20 00:12:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2014-11-20 01:46:04
lltyy: 金币+10, ★★★很有帮助, 专业 2014-11-20 02:05:26
如果是z矩阵结构输入，并且用默认的冗余内坐标方法优化，优化后的结构参数回在输出文件末尾显示（如果同时指定了opt freq，则在频率计算的步骤之前）。

如果用z矩阵坐标，z矩阵优化，并且指定了opt freq，优化好的参数在频率计算步骤的开始显示。

其它情况，需要自己找最后一步打印的结构。如果用直角坐标，需要人工排版，把核电荷数改成元素符号。也可以用Gaussview把结构另存。如果用z矩阵坐标，优化的结构参数在“Optimized Parameters”表格中。但是Gaussian的表格输出程序做的很繁琐，弄了很多画蛇添足的功能，导致数字的显示精度不够。这样的结构参数经常无法重复结果，所以最好到Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES)输出部分找这些参数。或者编个程序，从优化好的直角坐标重新计算z矩阵参数。
赞一下 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
7楼2014-11-20 00:57:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lltyy 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] filecode +14 等待解的谜 2026-08-06 18/900 2026-08-07 10:13 by naalan7001
[基金申请] 听说今天filecode变了 +21 布布和一二 2026-08-06 44/2200 2026-08-07 10:11 by 布布和一二
[基金申请] 基金中了 +9 laoda193707 2026-08-06 9/450 2026-08-07 08:54 by ZJTJZ
[基金申请] 固定端突然变了，今天 +4 archvillain 2026-08-06 8/400 2026-08-07 08:06 by 带你看大海
[基金申请] filecode +8 布布和一二 2026-08-06 11/550 2026-08-06 20:41 by tangpu318
[基金申请] 大家散了吧，后缀研究没有意义，别浪费时间了，过好目前的每一天，不要焦虑 +5 Tide man 2026-08-06 6/300 2026-08-06 20:19 by 苏知砚
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备？ 50+3 kf2781974 2026-07-31 12/600 2026-08-06 15:11 by eddyin
[基金申请] 求各位大神看下 100+6 hpkpkpkp 2026-08-05 33/1650 2026-08-06 14:49 by zhiyanjiang
[教师之家] 咨询面上基金 +4 李长云 2026-07-31 7/350 2026-08-06 11:20 by 李长云
[基金申请] 影响面上的因素 +8 布布和一二 2026-08-05 11/550 2026-08-06 10:41 by 宝贝虫子
[基金申请] 8月时间戳变的，举个手。玩一下，释放压力 +9 archvillain 2026-08-04 11/550 2026-08-05 20:06 by wlwhappy
[基金申请] 面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！ +22 低垂的野花 2026-07-31 30/1500 2026-08-05 18:03 by 低垂的野花
[基金申请] 好消息？这个有何含义？？？ +8 Tide man 2026-08-05 10/500 2026-08-05 16:14 by xmuxiaoyu
[考博] 【2027博士申请】纳米药物递送方向 20+3 13586093586 2026-08-03 4/200 2026-08-05 09:59 by lfy8008
[基金申请] 有没有H口的？有收到消息的吗？ +3 超级海虾 2026-08-04 3/150 2026-08-04 17:26 by 学教育滴
[论文投稿] 十年后又回来了，论文投稿求助 +3 哈哈114477 2026-08-01 3/150 2026-08-04 15:40 by tegsgjy20
[基金申请] 纯娱乐，不喜欢勿喷 +7 Tide man 2026-08-04 10/500 2026-08-04 15:10 by loufangrui
[基金申请] 面上提前没消息，有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 18/900 2026-08-04 14:42 by archvillain
[基金申请] 娱乐 +4 Tide man 2026-08-03 4/200 2026-08-04 11:51 by wgch518
[基金申请] 什么时候能放榜呀？ +3 Jacob678 2026-08-03 3/150 2026-08-03 16:14 by gltch
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭