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lltyy金虫 (小有名气)
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[求助]
结构优化后的笛卡尔坐标在哪里找呢? 已有3人参与
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审稿人意见,Cartesian coordinates of all the optimized geometries should be provided in the supporting information. 是不是要增加优化结构的笛卡尔坐标呢?不是搞计算的,不太懂,能不能请各位大神指教如何在计算结果里找到这一数据,万分感谢! |
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beefly
专家顾问 (职业作家)
地沟油冶炼专家
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3, 感谢应助 2014-11-20 01:46:04
lltyy: 金币+10, ★★★很有帮助, 专业 2014-11-20 02:05:26
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如果是z矩阵结构输入,并且用默认的冗余内坐标方法优化,优化后的结构参数回在输出文件末尾显示(如果同时指定了opt freq,则在频率计算的步骤之前)。 如果用z矩阵坐标,z矩阵优化,并且指定了opt freq,优化好的参数在频率计算步骤的开始显示。 其它情况,需要自己找最后一步打印的结构。如果用直角坐标,需要人工排版,把核电荷数改成元素符号。也可以用Gaussview把结构另存。如果用z矩阵坐标,优化的结构参数在“Optimized Parameters”表格中。但是Gaussian的表格输出程序做的很繁琐,弄了很多画蛇添足的功能,导致数字的显示精度不够。这样的结构参数经常无法重复结果,所以最好到Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES)输出部分找这些参数。或者编个程序,从优化好的直角坐标重新计算z矩阵参数。 |

7楼2014-11-20 00:57:42







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