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lltyy金虫 (小有名气)
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结构优化后的笛卡尔坐标在哪里找呢？ 已有3人参与
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审稿人意见，Cartesian coordinates of all the optimized geometries should be provided in the supporting information. 是不是要增加优化结构的笛卡尔坐标呢？不是搞计算的，不太懂，能不能请各位大神指教如何在计算结果里找到这一数据，万分感谢！ |
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【答案】应助回帖
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lltyy: 金币+10, ★★★很有帮助, 专业 2014-11-20 02:05:26
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如果是z矩阵结构输入，并且用默认的冗余内坐标方法优化，优化后的结构参数回在输出文件末尾显示（如果同时指定了opt freq，则在频率计算的步骤之前）。 如果用z矩阵坐标，z矩阵优化，并且指定了opt freq，优化好的参数在频率计算步骤的开始显示。 其它情况，需要自己找最后一步打印的结构。如果用直角坐标，需要人工排版，把核电荷数改成元素符号。也可以用Gaussview把结构另存。如果用z矩阵坐标，优化的结构参数在“Optimized Parameters”表格中。但是Gaussian的表格输出程序做的很繁琐，弄了很多画蛇添足的功能，导致数字的显示精度不够。这样的结构参数经常无法重复结果，所以最好到Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES)输出部分找这些参数。或者编个程序，从优化好的直角坐标重新计算z矩阵参数。 |
7楼2014-11-20 00:57:42