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【求助】实例请教有机分子rietveld拟合与原子占位率问题!谢谢!!
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再次呼唤热心虫友的出现了。![]() 这是一个二肽类分子的拟合,利用reflex plus拟合,采用rietveld with energy方法,同时优化了结构与能量,用的是pcff的力场。 拟合的参数有:晶胞参数,峰型参数(UVW,NA,NB),preferred orientation(March-Dollase),背景系数,对称参数(Berar-Baldinozzi),仪器零点,温度因子,原子坐标,没有拟合原子占有率, 最后得到的质量品质为:Rwp:10.03%; Rwp(w/o bck):24.65%; Rp:7.5% 得到的结构很符合假设,氢键网络较全,也没有靠得很近的原子对。 拟合结果见下图: 参数如下: Profile Function: Pseudo-Voigt U 2.45619 V -0.71714 W 0.06867 NA 0.71865 NB 0.00633 Zero Point -0.04270 Shift #1 -0.01301 Shift #2 1.04115 Asymmetry Correction: Berar-Baldinozzi P1 -0.20738 P2 0.26403 P3 0.26317 P4 -0.56410 Preferred Orientation a* 0.50405 b* 0.76018 c* -0.40994 R0 1.34694 Global Isotropic Temperature Factors U 0.00854 先谢谢大家了,我本不是这个专业的,自己凭借软件爱好,觉得挺有意思,折腾了这个东西,但对结果也没有太多判断力,不知道这样的结果能否达到一般的拟合标准,是否就可以了,还有各种参数有没有离谱的地方, 希望能得到各位的慷慨帮助,谢谢! [ Last edited by hanbao on 2008-5-18 at 13:42 ] |
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2楼2008-05-12 17:27:45
3楼2008-05-12 18:35:26
4楼2008-05-12 18:48:55
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本帖内容被屏蔽 |
5楼2008-05-12 20:33:10
6楼2008-05-12 20:52:48
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to conifer: 这是将原子占有率拟合完之后的数据,请帮忙看一看合不合理,谢谢! 此外,Rwp值只有6.7%, Rp:4.0%, Rwp(w/o, bck):16.8, No. Name Occupancy Refined? 1 H 0.99639 Yes 2 O 0.80647 Yes 3 H 1.00000 Yes 4 C1 0.85791 Yes 5 N1 1.00000 Yes 6 C2 1.00000 Yes 7 C3 0.60237 Yes 8 N2 0.61755 Yes 9 C4 0.78399 Yes 10 O1 0.65856 Yes 11 O2 0.42132 Yes 12 C5 1.00000 Yes 13 C6 1.00000 Yes 14 C7 0.90294 Yes 15 C8 0.59857 Yes 16 C9 0.98158 Yes 17 C10 0.98373 Yes 18 C11 0.72822 Yes 19 O3 0.26177 Yes 20 C12 0.43904 Yes 21 C13 0.48717 Yes 22 C14 0.71374 Yes 23 C15 0.30135 Yes 24 N3 0.70332 Yes 25 H1 0.92815 Yes 26 H2 1.00000 Yes 27 H3 0.70940 Yes 28 H4 0.89511 Yes 29 H5 1.00000 Yes 30 H6 1.00000 Yes 31 H7 0.83675 Yes 32 H8 0.87854 Yes 33 H9 1.00000 Yes 34 H10 0.99889 Yes 35 H11 0.97588 Yes 36 H12 1.00000 Yes 37 H13 0.92038 Yes 38 H14 0.48497 Yes 39 H15 0.99642 Yes 40 H16 1.00000 Yes 41 H17 0.93147 Yes 42 H18 0.56901 Yes 43 H19 1.00000 Yes 44 H20 0.52726 Yes 45 H21 1.00000 Yes |
7楼2008-05-12 21:01:48
8楼2008-05-14 10:46:46
9楼2008-05-15 17:41:43
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