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hanbao

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】实例请教有机分子rietveld拟合与原子占位率问题!谢谢!!

再次呼唤热心虫友的出现了。
这是一个二肽类分子的拟合,利用reflex plus拟合,采用rietveld with energy方法,同时优化了结构与能量,用的是pcff的力场。
拟合的参数有:晶胞参数,峰型参数(UVW,NA,NB),preferred orientation(March-Dollase),背景系数,对称参数(Berar-Baldinozzi),仪器零点,温度因子,原子坐标,没有拟合原子占有率,

最后得到的质量品质为:Rwp:10.03%; Rwp(w/o bck):24.65%; Rp:7.5%

得到的结构很符合假设,氢键网络较全,也没有靠得很近的原子对。

拟合结果见下图:

参数如下:
Profile Function: Pseudo-Voigt  
U 2.45619
V -0.71714
W 0.06867
NA 0.71865
NB 0.00633

Zero Point -0.04270
Shift #1 -0.01301
Shift #2 1.04115

Asymmetry Correction: Berar-Baldinozzi
P1 -0.20738
P2 0.26403
P3 0.26317
P4 -0.56410

Preferred Orientation
a* 0.50405
b* 0.76018
c* -0.40994
R0 1.34694

Global Isotropic Temperature Factors
U 0.00854


先谢谢大家了,我本不是这个专业的,自己凭借软件爱好,觉得挺有意思,折腾了这个东西,但对结果也没有太多判断力,不知道这样的结果能否达到一般的拟合标准,是否就可以了,还有各种参数有没有离谱的地方,

希望能得到各位的慷慨帮助,谢谢!

[ Last edited by hanbao on 2008-5-18 at 13:42 ]
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hanbao

银虫 (小有名气)

to conifer:
这是将原子占有率拟合完之后的数据,请帮忙看一看合不合理,谢谢!
此外,Rwp值只有6.7%, Rp:4.0%, Rwp(w/o, bck):16.8,

No. Name Occupancy Refined?
1 H 0.99639 Yes
2 O 0.80647 Yes
3 H 1.00000 Yes
4 C1 0.85791 Yes
5 N1 1.00000 Yes
6 C2 1.00000 Yes
7 C3 0.60237 Yes
8 N2 0.61755 Yes
9 C4 0.78399 Yes
10 O1 0.65856 Yes
11 O2 0.42132 Yes
12 C5 1.00000 Yes
13 C6 1.00000 Yes
14 C7 0.90294 Yes
15 C8 0.59857 Yes
16 C9 0.98158 Yes
17 C10 0.98373 Yes
18 C11 0.72822 Yes
19 O3 0.26177 Yes
20 C12 0.43904 Yes
21 C13 0.48717 Yes
22 C14 0.71374 Yes
23 C15 0.30135 Yes
24 N3 0.70332 Yes
25 H1 0.92815 Yes
26 H2 1.00000 Yes
27 H3 0.70940 Yes
28 H4 0.89511 Yes
29 H5 1.00000 Yes
30 H6 1.00000 Yes
31 H7 0.83675 Yes
32 H8 0.87854 Yes
33 H9 1.00000 Yes
34 H10 0.99889 Yes
35 H11 0.97588 Yes
36 H12 1.00000 Yes
37 H13 0.92038 Yes
38 H14 0.48497 Yes
39 H15 0.99642 Yes
40 H16 1.00000 Yes
41 H17 0.93147 Yes
42 H18 0.56901 Yes
43 H19 1.00000 Yes
44 H20 0.52726 Yes
45 H21 1.00000 Yes
7楼2008-05-12 21:01:48
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查看全部 11 个回答

hanbao

银虫 (小有名气)

在线等,请大家多指导指导罗,
2楼2008-05-12 17:27:45
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mandyneu366

铜虫 (初入文坛)

用的什么软件?GSAS还是FULPRO?
3楼2008-05-12 18:35:26
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hanbao

银虫 (小有名气)

用的是materials studio 4.0,它里面含有reflex plus模块。
4楼2008-05-12 18:48:55
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